佐助决定阻止宇智波斑的阴谋后，大蛇丸与鹰小队剩余成员一同赶往战场治疗五影。
大蛇丸和三代火影这对师徒，在面对神树分裂体时展现出了无与伦比的默契。大蛇丸首先发动了他的忍术——潜影蛇手，无数条毒蛇如闪电般迅速缠绕住了神树分裂体，使其动弹不得。
紧接着，三代火影毫不犹豫地挥舞起他那根着名的金箍棒，这根棒子在他手中仿佛拥有无穷的力量。只见他猛地一挥，金箍棒狠狠地砸向神树分裂体，瞬间将其打断成数段。
在不远处，纲手目睹了这一幕，她的目光落在了自来也的坟墓上。想起曾经与自来也的点点滴滴，她心中不禁涌起一股惭愧之情。
然而，战斗并没有结束。经过众人不懈的努力，十尾人柱力带土终于被击败了。但就在这时，一只神秘的漩涡状白绝突然出现在战场上，拦住了众人的去路。
这只白绝名为阿飞，他的实力深不可测。面对以三代目火影为首的忍者联军，阿飞毫无惧色，一场惊心动魄的恶战就此展开。
与此同时，佐助也遭遇了巨大的危机。他被复活的宇智波斑击倒在地，生死未卜。香磷心急如焚，想要立刻前去救治佐助，但大蛇丸却冷静地劝诫她和其他两人稍安勿躁，等待合适的时机再行动。
终于，在经过一番激烈的战斗后，大蛇丸四人终于等到了一个稍纵即逝的机会。他们毫不犹豫地抓住这个时机，施展出浑身解数，成功地压制住了强大的阿飞。
趁着阿飞被压制的瞬间，大蛇丸四人立刻抓住机会，如离弦之箭一般飞速突破了阿飞的包围圈。他们心急如焚，全速奔向佐助所在的地方，心中默默祈祷着能够及时赶到。
当香磷、水月和重吾三人赶到时，他们的心情异常沉重，因为他们不知道是否还来得及治疗佐助。然而，就在他们感到绝望的时候，一个意外的发现让他们燃起了希望——兜早已在那里，正全神贯注地救治着佐助。
时间一分一秒地过去，整个场面异常紧张。兜全力以赴地施展着他的医术，每一个动作都显得格外谨慎。经过一段漫长而焦急的等待，佐助的身体终于有了反应。他缓缓地睁开了眼睛，虽然眼神还有些迷茫，但显然已经脱离了生命危险。
就在这时，无限月读突然开启，一道耀眼的光芒笼罩了整个世界。大蛇丸和其他人都来不及反应，便一同被这股强大的幻术所笼罩。他们的身体被神树的分裂体紧紧缠绕，无法挣脱。
然而，幸运的是，无限月读最终还是被解除了。随着光芒渐渐消散，大蛇丸和其他人终于重获自由。他们感到如释重负，同时也对这场突如其来的变故感到后怕。
由于大蛇丸已经彻底改邪归正，并且在第四次忍界大战中带领鹰小队剩余成员立下了赫赫战功，所以他不再被列入叛忍名单中。这对于大蛇丸来说，无疑是一个全新的开始，他可以放下过去的包袱，重新回归正常的生活。
并且被允许在不涉及他人生命安全的情况下继续做实验，但仍需要被历代火影派人暗中监视。第四次忍界大战结束后十几年后鸣人接替卡卡西成为七代目火影。
在《博人传》这部作品中，大蛇丸展现出了令人惊叹的技术实力。他成功地对自己的身体进行了完美的改造，不仅让自己变得比以往更加年轻，还获得了再生能力。这意味着，即使他的身体受到了损伤，也无需像其他忍者那样通过结印来施展医疗忍术，受损的部位就能自动完成再生。
然而，一个新的敌人——宇智波信的出现，让鸣人和佐助意识到这其中可能与大蛇丸存在某种关联。于是，他们决定找到大蛇丸一探究竟。
当鸣人和佐助找到大蛇丸时，大蛇丸向他们透露了一些关于宇智波信的重要信息。原来，信并非普通人物，他实际上是大蛇丸的实验体之一。信的体质极其特殊，对于移植在自己身上的任何组织都不会产生排斥反应。
基于这一独特的体质，大蛇丸在信的身上进行了一系列大胆的实验。他将许多团藏在宇智波灭族事件中收集到的写轮眼移植到了信的身体里。这些写轮眼赋予了信强大的力量和特殊能力。
不仅如此，大蛇丸还将信已经移植好各种写轮眼的右臂送给了团藏，成为了团藏的新右臂。这一举动无疑让团藏的实力得到了极大提升，同时也让信成为了一个极其危险的存在。
大蛇丸不仅曾经使用信的细胞成功克隆出了大量信的克隆人，而且这些克隆人在一定程度上保留了信的某些特质和能力。然而，后来信却带着一部分克隆人毅然决然地离开了大蛇丸。
在剧场版《火影忍者剧场版：博人传》中，有这样一个情节：当博人和佐良娜好奇地询问巳月关于他父母的事情时，巳月毫不犹豫地回答说他的父母是大蛇丸。面对佐良娜进一步追问大蛇丸到底是他的爸爸还是妈妈时，巳月则表现得十分淡然，他回答道：“我倒觉得不管算是爸爸还是妈妈都无所谓啦。”就在这时，画面一转，我们看到大蛇丸正躲在不远处，默默地观察着这一切。
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