就在两军纠缠的时候，从崤山上面有杀下来几路赤眉军。赤眉军主将谢禄也没有多想，当时已经陷入了混战，眼看用不了多久便大胜的时候，赤眉军中突然大乱。赤眉军自己竟然相互厮杀起来，还没等谢禄反应过来除了什么事的时候。从山上突然冲下来数不清的刘秀大军，向着主将这边冲杀了过来。
这时，就见赤眉军中有人大喊：“败了！我们中了埋伏了……谢禄将军战死了……大家逃啊…….”
第一个人喊起来之后，整个赤眉军当中便不断有人附声。不知道情况的赤眉军士兵看到从山上冲下来的刘秀军本来已经有些慌乱，当下都以为已经溃败。当下抛下了手中的兵器，纷纷向后逃去。
谢禄砍杀了几名逃兵，正要组织自己的亲兵阻拦溃兵的时候。一名赤眉军士兵一把将谢禄从马上拽了下来，周围七八个士兵一拥而上，将谢禄杀死在乱军当中。
这一下子，赤眉军的主将便当真战死了。赤眉军中大乱，转眼之间死伤过半，只有三四成的赤眉军逃了出去。
此战之后，赤眉军主力尽损。樊崇带着建世帝刘盆子出离长安，转战多地之后，被刘秀大军包围在了宜阳。粮尽之后无奈之下，建世帝带着丞相和文武百官，光着身子赤身裸体的出来向刘秀投降。趁乱当中，赤眉军首领樊崇逃离了宜阳。
刘秀也算厚待了刘盆子，力排众议保住了他的性命，封他在赵王手下左了一名郎官。刘盆子年老之后，刘秀又赏赐了他一处封地，靠着封地赋税养老直至老死。
除了刘盆子之外，其余赤眉军的官兵也都分了田地。他们大都本是农民出身，只是王莽乱政之时没了土地这才被樊崇等人鼓动造反了。有田有地之后，也都绝了反叛之心。
赤眉军当中，只有匪首樊崇一人没了踪影。就在天下初定，刘秀准备称帝的时候。洛阳城内的一座小酒肆当中，一个中年壮汉正对着一个白头发有些阴柔的男人说道：“你助我除掉刘秀，得了天下，我便帮你消除方士一门……”
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