因此，努尔哈赤于该年又增设四旗，将原来的旗帜周围镶上其它颜色。黄、白、蓝旗镶红边，称作镶黄、镶白、镶蓝旗；红旗则镶白边，称作镶红旗。
它们与原本的纯色的正四旗合称“八旗”，此后旗色再未有变化。
当时各旗尚由大汗与各旗主贝勒分别掌控。
在八旗成立之初，旗的名目上并无民族属性之分。
在清太宗皇太极即位后的1629年（明朝崇祯二年，清天聪三年），才开始有蒙古二旗的记载。
从努尔哈赤建立后金天命元年到天聪八年，后金的兵制是典型兵民合一的八旗制度。
八旗初建时兵民合一，全民皆兵，凡满洲成员皆隶于满洲八旗之下。旗的组织具有军事、行政和生产等多方面职能。
入关前，八旗兵丁平时从事生产劳动，战时荷戈从征，军械粮草自备，没有军饷规定。有典型的部落兵制的特点。
天聪四年皇太极说：“我国出则为兵，入则为民，耕战二事，未尝偏废。”当时，兴京（今辽宁新宾）内城居宗室勋戚，外城居宿卫亲兵万余。此外远近十余万户，散处辽河东西，无事耕猎，有事征调，征调时所发行粮也很有限。
努尔哈赤于1615年完成满八旗的全部编制。（即正黄、正白、正蓝、正红、镶黄、镶白、镶蓝、镶红八旗）。
八年改称左翼兵和右翼兵。九年，后金在征服察哈尔蒙古后，对众多的蒙古壮丁进行了一次大规模的编审，正式编为蒙古八旗，旗制与满洲八旗同。汉军单独编为一旗，其制规定：每300人为1牛录，设牛录额真1人；5牛录为1甲喇，设甲喇额真1人；5甲喇为1固山，设固山额真1人。
1615年，当时编有满洲牛录308个，蒙古牛录76个，汉军牛录16个，共400个。此时所编设的八旗，即后来的满洲八旗。
八旗的旗丁中按照身份地位，分为阿哈、披甲人、和旗丁三种。阿哈即奴隶，多是汉人、朝鲜人；披甲人是降人，民族不一，地位高于阿哈；旗丁是女真人。
披甲人又分马甲（骑兵）和步甲（步兵）。
八旗的最小单位是牛录，最初牛录既是一种社会组织，也是作战时的一个单位编成，每牛录300户，每户出一个壮丁，父死子继，兄亡弟代，在全军出动时才有每牛录300人。
从天命年间开始牛录就渐渐不是军事单位，而是行政户籍单位，每出兵则从各牛录中取若干人别成军。这些自牛录中抽来的人，挑选出来最能打的勇士为巴牙喇兵，马甲为阿里哈超哈兵。
披甲人：分为马甲和步甲两种。后金常规军力，也就是主力为职业军人，不纳粮、不耕种，数量为“三丁抽一”：“每牛录满洲三人中许一人披甲，以六十名为常数。”
按照五万左右的“人丁”数计算，主力约1.5万人左右，称为“披甲人”。又由于“披甲人”出征期间会带上若干“厮卒”（即阿哈）协助抢掠，即看管财物、俘虏，所以如果一万“披甲人”出征，那整个队伍就不仅只有一万人不过由于“厮卒”是奴隶，所以不算在“人丁”以内，故没有严格规定带多带少，只能估算。
如果按照每个“披甲人”带一两个“厮卒”计算，一万披甲人出征，那的规模将达到2到3万。
巴牙喇兵是从满蒙各旗牛录中挑选出来最能打的勇士。当时一个牛录行政单位要提供十七名巴牙喇兵，而一旗所辖牛录，少者十余牛录，多者四十余牛录，因此各旗巴牙喇纛章京，所辖巴牙喇兵，少者二百多人，多者也不过六七百人，但多是极为精锐的部队，因此在奴廷里的位置也颇为重要。
不过巴牙喇营出征时也未必足额。因此奴营中采用每牛录多少兵、多少巴牙喇的计数法。如崇德三年九月二十二日，清兵从密云县北墙子岭毁墙入明境，分为四路，令纛章京图赖率右翼每牛录巴牙喇兵一名，及喀喇沁每旗巴牙喇甲喇章京一员，从岭之右侧步越高峰而进。（崇德三）崇德元年十二月，清太宗亲征朝鲜，二十一日闻朝鲜四道合兵来援，遂选八旗每二牛录巴牙喇一人，每两旗甲喇章京一员，以阿尔津统之截其来路；又遣巴牙喇纛章京巩阿岱等率每牛录巴牙喇一人往助多铎。
建奴这个时期的骑兵战术已经发展将臻炉火纯青的境界，将领亲卫、战场侦察和反侦察轻骑兵、战术预备队、战场宪兵等作用，配合的相当完善。
这是建奴入关之前的军队情况，另外还有一股汉人降兵是单独配置的，叫天佑兵、天助兵。
1633年孔耿之乱，孔有德及耿忠明跨海降后金，所余残部辽东东江兵编为天佑兵。1634年尚可喜携麾下东江诸将、辖下五岛军资器械航海弃明投金，部队被封为“天助兵”，发还被俘人口，封总兵官；东江兵战力极高，曾数次大胜八旗军。在丁卯之役中，三战三捷，杀固山三、牛鹿八人，斩六千余级。使得拥有数万骄兵悍将的镶蓝旗精锐丧尽，即使休整两年也未恢复元气，其余参战后金军也多有损失。耿忠明更亲自打出大捷，斩级三千，擒生六十九人。
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