“五军都督府以左都督为长、右都督为教导使，级别暂定为正三品，负责各兵种的建设。”
“陆军都督府以卢俊义为左都督、鲁智深为右都督，水军都督府以李俊为左都督、阮小二为右都督，中军都督府以武松为左都督、公孙胜为右都督，卫军都督府以柴进为左都督、李应为右都督，番军都督府以晁盖为左都督、耶律大石为右都督。”
“各都督府设庶务处，以正六品主事负责，专掌文牍事务。”
将五军都督府的编制定了下来，并任命了左右都督，朱武察觉到卢俊义、鲁智深等统兵的将领，明显更高兴些。
想来他们也知道军务院是由参谋处和教导处主导，他们这些武将，不可能主持军务院。这个和军务院分庭抗礼的五军都督府，明显更适合他们。
自此，军中高级将领的晋升道路，开始出现分野。有了五军都督府，军中将领想要晋升时，就不必一直盯着军务院。
这种权力的流逝，自然让军务院上下有些不甘。作为事实上的军务院第一人，吴用虽然没有办法阻止这件事，却同样代表军务院，提出自己诉求：
“军务院执掌调兵权，若是没有军衔，如何调遣军队？”
“请主公一视同仁，同样授予军衔！”
说着，吴用还提到了朱武曾经授予的军师中郎将，请朱武免去此职，改为授予军衔。
朱武闻言沉吟，这才想到自己以前为了拉拢吴用等人，给他们授予的中郎将。这次调整军衔时，同样要考虑到这点。
思索之后，朱武向吴用道：
“中郎将在唐朝是正四品下，和中将的散官级别相当。所以中郎将的军衔，应该转为中将。”
“军师功勋卓着，再担任中郎将已有些屈就，可以为军师将军，以上将军衔主持参谋处。”
“这次改制之前就在军务院工作的人员，可以按拥有的品级授予相应军衔。改制之后的军务院人员，除非军中出身、拥有军衔三年以上者，不再授予军衔。”
“没有军衔的军中官员，可称之为文职军官。文职军官有相应品级待遇，没有指挥权限。”
回应了吴用的诉求，朱武看他还有一些不足，又继续道：
“文职军官可以按散官级别，转任相应文官。”
“拥有军衔的军官则需要退出现役、通过相应培训后，才有资格转业。”
“如今各地官员都还不足，若有人想转任地方，可以直接提出来。”
吴用闻言大喜，认为这个回应，已经足够他向军务院人员交待。想来那些人在知道文职军官可以直接转任文官后，都会欢呼雀跃。未来也一定会有人，用文职军官这条途径，成为文武官员。
和众人商量许久，将军衔制和军官品级调整的事情确定下来，朱武又留下吴用，召集蒋敬、萧让、朱贵、裴宣、耶律大石等政务院和都察院主官，商议文官品级。
有军务院的例子做参考，政务院人员的品级很快确定下来。以参赞政务头领为正三品政务参赞，并且设正四品参议、正五品议郎、正六品主事，主持政务院事务。
都察院则废除院长、副院长，改为正三品左右都御史，并且设正四品佥都御史，主持都察院各处。与此同时，朱武还设立正七品监察御史一职，授予他们独立监察权，监察各地事务。
“除了监察御史外，明朝还设有给事中，负责封驳政令、弹劾百官。”
“但是如今在打天下之时，一切以提高效率为先，给事中可以先不设，等以后各处提升为部后，再成立这个机构。”
思索着明朝的监察机构设置，朱武对都察院还负责的审判职责，不免有些忽略。耶律大石说道：
“臣自接任以来，发现都察院各处并不以监察为要。反而把主要的精力，用于审判案件。”
“将军欲以都察院为御史台，应该把审判职责，从都察院分开。”
“让都察院专心监察，不为它事分心！”
被耶律大石提醒，朱武这才想到，梁山泊的审判职责，如今还放在都察院。
这种为了简便把法律事务都放在都察院的做法，在如今正式建立官制后，已经不合时宜。必须要建立新部门，拆分法律机关：
“审判机关要独立，不受其它机关干涉。”
“官员也应该专心政务，不要老想着去断案。”
“可以设立大理院和各级法院，把审判机关独立出来。”
“都察院在监察的同时，也可以代行检察院职责。”
“政务院也应该有部分，负责司法执法。”
倾向于把法务和政务、军务分开，朱武很快决定，成立大理院和各级法院，专门负责审判：
“大理院负责申辨冤枉，审判定罪，解释法律，监督各级审判，复核死刑案件。”
“大理院设正卿一人，级别暂定为正三品，由裴宣兄弟担任。”
“另设大法官数人，负责审判案件。”
向裴宣说着任命，朱武吩咐他从都察院抽调人手，将大理院庶务处、刑事处、民事处组建起来，然后在地方建立各级法院，选拔法官审判。
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