第一节：星穹异动·全宝可梦的危机预警
“羁绊号”飞船在星穹中平稳航行，甲板上洒满星穹特有的银蓝色星光。经历过时空噬主的封印战后，全员正处于短暂的休整期。天桐在厨房忙碌，炒炒猪的火焰烤制着阿罗拉树果，差不多娃娃在一旁递上丰缘特产的能量香草，空气中弥漫着混合了各地区风味的食物香气：“这是‘星穹安神能量餐’，加入了杰可罗拉的深海贝肉和伽勒尔的能量麦芽，能彻底修复大家战斗后的隐性损伤，还能提升对未知能量的感知力。”
莉莉艾坐在观景台的长椅上，谢米趴在她膝头，叶片散发着淡淡的净化光芒，木木枭则站在栏杆上，警惕地观察着星穹的动静。她翻开阿罗拉究极遗迹的手稿，指尖划过上面的暗纹：“根据手稿记载，星穹的时空屏障之下，还隐藏着一股原始黑暗能量，名为‘暗源之核’，它是所有暗能的根源，时空乱流只是它苏醒的前兆。”
哈乌靠在栏杆上，捷拉奥拉趴在他肩头，鬃岩狼人（黑夜形态）在脚边来回踱步，卡璞·鳍鳍的水属性能量在周围形成淡淡的涟漪：“刚才捷拉奥拉的雷电感应到异常，星穹深处有强烈的能量波动，和之前暗能之主、时空噬主的能量都不同，更加纯粹，也更加狂暴。”
就在这时，飞船内突然传来一阵急促的宝可梦鸣叫。皮卡丘从小智肩头跳下，颊囊泛起强烈的绿金色电光，眼神中满是警惕；喷火龙展开双翼，Mega Y形态的鎏金火焰自动燃起，对着星穹深处发出低沉的咆哮；烈咬陆鲨的鳞片竖起，Mega进化的暗绿色光泽在体表流转，龙威扩散开来；甲贺忍蛙的水袖紧绷，羁绊进化+星穹共振的蓝绿黑三色纹路闪烁，水纹陷阱在脚下悄然展开；奈克洛兹玛的光之能量爆发，形成一道淡金色的防护屏障，将飞船核心区域护住；超梦悬浮在空中，精神力扩散至极致，眉头紧锁：“是黑暗能量，比时空噬主的能量强十倍以上，正在快速逼近，目标是我们手中的星穹之心！”
所有宝可梦都表现出强烈的危机感应：拉帝欧斯与拉蒂亚斯的双生身影在飞船周围盘旋，洁净龙息形成防护圈；黄昏鬃岩狼人的岩石能量汇聚，形成坚固的岩石壁垒；炽焰咆哮虎的恶火燃烧，随时准备突袭；美录梅塔的液态金属覆盖全身，钢之守护启动；盖诺赛克特的机械臂展开，超新星炮蓄能待发；就连寄存的宝可梦也通过星穹印记传来紧急信号——妙蛙种子的藤鞭在大木研究所的庭院中疯狂生长，杰尼龟的水炮对着天空喷射，卡比兽从沉睡中苏醒，发出威严的咆哮；丰缘的蜥蜴王、赫拉克罗斯、大王燕朝着星穹方向飞去；阿罗拉的毒贝比释放毒龙能量，试图跨空间支援；烈空坐的龙啸穿透星系，星穹能量通过印记源源不断地传递给小智。
小智握紧星穹之心，水晶传来剧烈的震颤，与所有宝可梦的羁绊能量产生强烈共鸣：“这股能量……是暗源之核！莉莉艾说得对，它才是星穹所有黑暗的根源！”他抬手按下通讯器，“全员进入战斗状态！小霞，水系控场；莎莉娜，战术分析与治愈；天桐，强化能量餐补给；哈乌，场地控制；莉莉艾，净化支援！宝可梦们，星穹共振准备！”
小霞立刻召唤出美纳斯、星水鱼、汐蓝，水属性能量在周身形成淡蓝色光晕：“星水鱼、汐蓝，星晶水炮·探测版！美纳斯，神秘守护·全域！先锁定暗源之核的位置！”星晶水炮射向星穹深处，水纹扩散开来，传递回能量波动数据；美纳斯的神秘守护屏障扩大，将整个飞船包裹。
莎莉娜的战术笔记本飞速翻动，沙奈朵和克雷色利亚的精神力与超梦同步：“根据探测数据，暗源之核在星穹枢纽的时空裂隙深处，它正在吸收时空乱流的残余能量，预计十分钟后抵达我们所在位置！它的能量特性是‘侵蚀羁绊’，能瓦解我们的星穹共振！”她抬头看向小智，眼中闪过一丝担忧，“我们必须在它靠近前，强化所有宝可梦的羁绊能量，否则战斗中会被它逐个击破！”
天桐推着能量餐车跑出来，差不多娃娃跟在身后分发能量餐：“快吃！这是紧急强化版，能在五分钟内提升羁绊能量的稳定性，抵抗黑暗侵蚀！”
哈乌指挥捷拉奥拉和卡璞·鳍鳍：“捷拉奥拉，雷电领域·羁绊强化！卡璞·鳍鳍，潮旋·净化！用雷电能量强化宝可梦的羁绊连接，潮旋净化周围的黑暗能量残留！”
莉莉艾的谢米释放最大范围的净化领域，木木枭的空气斩将靠近的黑暗能量碎片击落：“谢米，芳香治疗·羁绊稳固！木木枭，空气斩·拦截！尽量为大家争取强化时间！”
小智看着全员有条不紊地行动，心中涌起一股暖流。从关都到星穹，从最初的三人小队到如今的全员集结，这些伙伴和宝可梦，早已成为他生命中不可或缺的一部分。他握紧星穹之心，眼神变得无比坚定：“不管暗源之核有多强，我们都不会让它破坏星穹的和平！”
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