骸骨龙帝伏诛，北境亡灵大军溃散，持续了数月之久的惨烈战争终于落下帷幕。然而，胜利的喜悦并不能立刻冲散战争留下的创伤。
万龙祖地，尤其是曾经的交战区域，满目疮痍。大地被死气浸染，草木枯萎，河流污浊，许多地方需要漫长的岁月才能恢复生机。龙城联盟方面，兵员损失超过三成，中低层军官伤亡尤为惨重，大量战争器械损毁，储备的资源几乎消耗一空。混沌龙巢及其他盟友也元气大伤，以待休养。
龙毅虽自身伤势沉重，本源受损，左臂暂时无法动用，但他并未立刻闭关疗伤。他知道，此刻人心浮动，百废待兴，正是需要他这位龙主稳定大局的时候。
他强撑着伤体，颁布了一系列战后安抚与重建法令：
《抚恤令》： 成立专门的抚恤司，由云璃协助管理，对所有阵亡将士家属给予丰厚的抚恤，其直系后代可由龙城供养至成年，并享有优先进入龙武军或百工院的资格。对伤残者，给予终身奉养与荣誉爵位。
《清秽令》： 组织由木皇老祖神力引导的净化队伍，联合星灵族提供的星辰净化技术，对受死气污染的区域进行大规模净化，尽快恢复土地生机。
《垦荒令》： 鼓励所有龙族及附属种族，开垦因战争荒废或无主的土地，前三年免除一切赋税，并由龙城提供种子、农具和基础阵法庇护。
《军功厚赏令》： 依据战功，对幸存将士进行大规模封赏，土地、资源、功法、爵位，毫不吝啬。尤其是那些在关键时刻挺身而出、战功卓着的勇士，如独眼仍奋勇杀敌的敖战、剑道愈发凌厉的青羽、侦查立功的影子等，皆获重赏，树立榜样。
这些法令的颁布，如同一股暖流，抚慰了战争带来的伤痛，迅速稳定了民心军心。所有生灵都看到，龙主并未因胜利而忘乎所以，而是切实地在为生者谋福，为死者尽哀，为未来铺路。龙毅的威望，在战后不降反升，达到了一个全新的高度。
局势初步稳定后，龙毅开始着手进行更深层次的整合。万龙祖地势力纷杂已久，如今强敌已去，若不尽快确立统一的秩序，恐生内乱。
他召集了龙城核心、混沌龙巢族老会代表、星灵族长老星轨、以及一些较大归附部落的首领，于龙城新建的“万龙殿”内，举行了为期三天的“定鼎之会”。
会议上，龙毅并未以武力强压，而是以《星穹龙帝谱》中记载的上古龙庭制度为蓝本，结合现状，提出了一套相对完善的管理体系：
确立“龙庭”为万龙祖地唯一正统政权。 龙毅为龙庭之主，尊号“星穹龙帝”。下设“长老院”，由各方势力推举德高望重或实力强大者担任长老，负责议事、咨询、监督；“战神府”，由敖战任大元帅，总领龙庭一切军事力量；“百工阁”，整合原龙城百工院与各方技术力量，由龙毅直接掌管，负责研发、生产与资源调配；“巡天司”，由影子负责，监察四方，缉捕不法，收集情报。
颁布《龙庭基本典》。 法典明确规定了龙庭境内所有种族、部落的权利与义务，强调了在龙庭律法面前一律平等，禁止私斗，资源按功分配等基本原则。同时，将之前实行的“功勋体系”正式纳入法典，成为龙庭晋升与获取资源的核心渠道。
划分行政区域。 将整个万龙祖地划分为九州，设州牧管理，直接对龙庭负责。原混沌龙巢区域设为“琉璃州”，由云璃兼任首任州牧；原曜部核心区域设为“圣龙州”，由敖战兼任州牧……以此类推，打破了原有部落壁垒。
规范力量体系。 参考《星穹龙帝谱》及星灵族的经验，初步确立了从“幼龙”到“龙帝”的九阶力量评定标准，并开始在龙庭范围内推行统一的修炼引导，旨在提升整体实力。
这一套组合拳下来，一个集权、高效、相对公平的新生政权雏形，逐渐显现。虽然各方势力仍有自己的小算盘，但在龙毅如日中天的威望、强大的实力以及《星穹龙帝谱》带来的知识红利面前，都选择了顺应大势。万龙祖地，真正开始从一个松散的联盟，向一个统一的龙族帝国迈进。
处理完最紧要的政务，将具体事务交由长老院和各大机构负责后，龙毅终于得以卸下重担，开始专心应对自身的伤势。
与骸骨龙帝一战，他透支太过严重。混沌星枢布满裂痕，近乎停滞；左臂经脉尽碎，被那股超越极限的“生”之法则反噬，若非祖龙脉生机吊着，早已彻底坏死；神魂也因强行引动源初星核和施展“万物复苏之枪”而受创不轻。
他选择了进入龙骨圣山最核心的“龙眠古洞”深处闭关。此地龙气最为精纯浓郁，且与祖龙脉相连，最适合他疗伤与悟道。
闭关室内，龙毅摒弃一切杂念，首先运转《星穹龙帝谱》中记载的最高疗伤秘法——“星辉龙源涅盘术”，引动祖龙脉生机与周天星力，如同最精细的工匠，一点点地修复着混沌星枢的裂痕，温养受损的神魂。
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