新岛真之后没多久便开始了佐仓双叶事件。
和新岛真不同，佐仓双叶事件各方面的规模都要大得多，不论是社会影响，还是关于剧情轨迹的推进，乃至对团员自身的成长和觉悟。
佐仓双叶，听名字就知道和怪盗团的总据点，袁满很中意的咖啡店“勒布朗”老板佐仓惣治郎有关。
实际也确实有关，双叶是惣治郎的女儿，没有血缘关系的那种。
惣治郎曾经当过公务员，因为公务认识了从事秘密研究双叶的母亲，一色若叶。两人相交莫逆，至于两人之间有没有超出友谊的关系，只有惣治郎自己知道。
在双叶年幼的时候，某些人看中了一色若叶的研究，想要独占成果，为己所用，设计了一场车祸在双叶面前谋害了她，并伪造了一份遗书，说她的死是因为女儿双叶所带来的精神压力。
双叶的亲属为此怪罪双叶，把她视作灾星，唯有惣治郎挺身而出，从争吵不休的亲属团手中取得了双叶的抚养权，将其收为养女。
然而，因为母亲在眼前去世以及遗书的影响，双叶陷入了自闭，整天宅在房间里，别说出去见人了，连走出房门都困难。
惣治郎无奈，只能默默守望着她，尽量不去惊扰。同时也因为一色若叶的死心怀疑虑，却因为能力有限查不出真相，最终饮恨离职，到“四轩茶屋”开起了咖啡厅。
另一边，当年谋害一色若叶的人也盯上了“心之怪盗团”。
一色若叶当年研究的项目正是“认知领域”“印象空间”，得到了研究成果的幕后黑手很容易就能想将怪盗团和认知领域联系在一起。
为了对付怪盗团，黑手选择了一个非常阴险的手段——以黑制黑。
黑客组织“梅杰德”对付怪盗团。
手法异常简单粗暴，就是威胁，逼你们公开身份，你们不出来我们就对日本发动黑客袭击，黑交通，黑电厂。
这一招非常狠毒。
怪盗团标榜的是正义的伙伴。
如果你们为了保全自己，无视黑客的恶行，那就是背离正义，好不容易经营起来的人设便会一朝崩塌。
如果你们公开身份，怪盗团也会失去隐匿在暗处的最大倚仗，一群学生当怪盗的影响可不好。
偏偏黑客都是用存在于网线之后，身份不明的不存在，找不到人就无法改心，等于废除了怪盗团最大的倚仗。
进退两难。
就在这时，团长雨宫莲收到了另一位黑客“阿里巴巴”寄来的信。
要求怪盗团来偷走自己的心，自己则可以帮助他们摆脱目前的困境。
这个“阿里巴巴”正是佐仓双叶，目的是为了借助怪盗团的力量让自己摆脱自闭。
整天自闭在家无所事事，双叶唯一能做的就是上网，也因此练就了一身黑客本事，成为世界上首屈一指的顶级黑客。
就连威胁怪盗团的“梅杰德”其实也是她创立的，只是发展壮大后就再没管过，结果被别有用心的人掌握。
按照正常流程，走投无路的怪盗团只能选择相信双叶，努力帮她改心，双叶也正好在这个过程中觉醒人格面具，顺势加入主角团，摆平黑客事件，成功度过难关，实现双赢。
不过有鲁路修在就不一样了。
见识过他在新岛真事件中的手段，怪盗团遇到黑客威胁怎么可能不去找鲁路修。
鲁路修也没推辞，一个人力挽狂澜，对抗组织什么的他最擅长了。
反正最近十一区一切都上了正轨，要他亲自出面的事越来越少，学校的课程也早就自学完了，每天上学对他来说除了上课睡觉，学生会活动，定期和袁满发信息交流，也没有其他安排，正愁闲着没事做。
再者他本人也对女神异闻录世界背后隐藏的东西很有兴趣，正好借这个机会一探究竟。
于是，在某个风和日丽的午后，鲁孔明同学带着他的笔记本再次开始了异世界黑客之旅。
花了一个下午的时间顺着网线挨个问候了一遍。
我知道你家住哪，知道你的身份，
给我乖乖听话，不要胡闹。不然在你们攻击日本前，我先把你们的身份掀出来。
我不知道你们之中哪些人参与了这次行为，只要有一个乱来的，我视作是你们的共同行为。
“梅杰德”当然不肯善罢甘休，想要反入侵鲁路修，结果被早有准备的鲁路修打得落花流水，少说崩溃了几十台电脑。
在网上虐了一群弟弟之后，鲁路修感觉状态正好，又反手去追查“阿里巴巴”。
没想到这次差点栽了。
原来鲁路修之前在“梅杰德”那里闹得太大，连退隐的元老都被惊动了，双叶也得到了消息，猜到他们有可能和怪盗团有关。
联想到之前自己的行为，她做好了防备，正好鲁路修撞枪口上。
大家都是世界顶级，而双叶占有主场和设备的双重优势——她在家里，设备一应俱全，鲁路修在天台，就一台笔记本。
之前是有心算无心，外加“梅杰德”壮大后成员良莠不齐，不少老资格成员本就对因为“怪盗团”攻击日本一事心存不满，故意袖手旁观，甚至推波助澜，这才一路顺风顺水。
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