永平十八年，也就是公元75年，汉明帝去世了，汉章帝即位。消息传到西域，匈奴趁机反扑，龟兹、姑墨等国也跟着匈奴，攻打疏勒。班超当时手下只有几千人，还都是西域各国的士兵，形势十分危急。
章帝刚即位，担心班超在西域寡不敌众，就下诏让班超回国。班超接到诏书，收拾行装准备回去。
疏勒的百姓听说班超要走，都哭了起来。一个疏勒大臣拉着班超的马缰绳，跪在地上说：“班大人，您要是走了，匈奴和龟兹肯定会来杀我们，我们宁愿跟着您死，也不想让您走啊！”
班超见疏勒百姓对自己这么忠诚，心里像被针扎一样难受。他想了又想，最终下定决心：留下来！就算违抗诏书，也要保护疏勒百姓！他上书章帝，说明西域的形势，说只要朝廷派些援兵来，他就能平定西域的叛乱。章帝见班超意志坚定，又了解到西域的情况，就答应了他的请求，派了一千多名援兵去西域。
有了援兵，班超的底气更足了。他率军打败了姑墨，又平定了莎车，西域的局势渐渐稳定下来。到了章和元年，也就是公元87年，西边的大月氏国（也就是后来的贵霜帝国）想和汉朝结盟，还请求娶汉朝的公主。班超觉得大月氏野心不小，就拒绝了他们的请求。
大月氏王很生气，派了七万大军，由副王谢率领，来攻打班超。当时班超手下的兵力只有几千人，部下都很害怕，说：“班大人，大月氏人多势众，咱们打不过啊，不如撤退吧？”
班超却很镇定，对部下说：“大月氏的军队虽然多，但他们从千里之外来，粮草肯定跟不上。咱们只要坚守不出，断了他们的粮道，用不了多久，他们就会不战自溃。”
于是，班超下令坚守城池，不准出战。大月氏军队攻打了几天，都没能攻破城池，粮草也渐渐少了。班超早就派了人在大月氏军队的粮道上埋伏，等大月氏的运粮队一来，就把粮草抢了过来，还杀了不少运粮的士兵。
副王谢见粮草被劫，慌了神——没了粮草，七万大军怎么打仗？想撤军又怕班超追击，想求和又拉不下脸。班超知道大月氏已经没了斗志，就派人去劝谢投降。谢没办法，只好派人向班超求和，请求班超放他们回国。班超答应了，大月氏军队就这样狼狈地回去了。经此一战，大月氏再也不敢得罪汉朝，反而每年都派人来汉朝进贡。
到了永元六年，也就是公元94年，班超已经在西域待了二十一年，朝廷任命他为西域都护，掌管西域各国的事务。当时还有焉耆、危须、尉犁三个国家没有归附汉朝，这三个国家之前还杀过汉朝的使者，和匈奴关系密切。班超决定彻底平定这三个国家，统一西域。
他召集了龟兹、鄯善等八国的军队，一共几万人，讨伐焉耆。班超先派人去见焉耆王广，劝他归附，说：“我这次来，是想安抚你们，要是你们愿意归附，就赶紧来见我，我会赏赐你们；要是你们不愿意，就等着军队来攻打吧。”
焉耆王广害怕班超的军队，就带着大臣来见班超。班超设宴招待他们，在宴会上，班超责问焉耆王广之前杀汉朝使者的事，然后喝令手下把广和他的大臣都绑起来，押到之前汉朝使者被杀的地方，杀了他们，用来祭奠汉朝的使者。
然后，班超率军攻打焉耆的城池，杀了五千多个反抗的人，俘虏了一万多人，还缴获了很多财物。他立了一个亲汉朝的焉耆人为王，安抚焉耆的百姓。危须、尉犁两国见焉耆被平定，赶紧来归附班超。
至此，西域五十多个国家都归附了汉朝，丝绸之路重新畅通，汉朝的号令在西域通行无阻。班超在西域三十一年，从一个抄书的文人，变成了西域的守护神。
到了永元十二年，也就是公元100年，他已经七十岁了。常年的风沙和征战，让他的身体越来越差，眼睛花了，耳朵也有点聋了，最想念的，就是家乡的亲人。
他上书汉和帝，请求回国，奏疏里写着：“臣不敢望到酒泉郡，但愿生入玉门关。”意思是说，他不敢指望能回到酒泉，只要能活着进入玉门关，回到汉朝的境内，就心满意足了。
和帝看了班超的奏疏，很感动——一个七十岁的老人，为了国家在西域坚守了三十一年，现在只想回家，怎么能不答应呢？于是，和帝下诏让班超回国。
永元十四年，也就是公元102年，班超终于回到了洛阳。和帝亲自设宴招待他，任命他为射声校尉。可班超的身体已经不行了，回到洛阳没几个月，就病逝了，享年七十一岁。
《后汉书》里说他“在西域三十一年，西域五十余国悉皆内属”，这是对他最大的肯定。他投笔从戎，凭着自己的英勇和谋略，在万里之外的西域，以少胜多，恩威并施，平定了五十多个国家，让汉朝重新控制了西域，保障了丝绸之路的畅通，为国家立下了不朽的功勋。他被誉为“西域守护神”，真是当之无愧！
班超死后，他的儿子班勇继承了他的事业。班勇从小就跟着父亲在西域长大，熟悉西域的情况。后来匈奴又想控制西域，汉朝派班勇出使西域，班勇像他父亲一样，平定了西域的叛乱，延续了汉朝对西域的管辖。
班超父子两代人，都为保卫汉朝的边疆、经营西域做出了巨大的贡献。这样的英雄，这样的家族，在历史上也是不多见的。
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