经过数月艰苦的研究，联合科研团队终于在能源晶体与联盟能源系统的兼容性问题上取得了重大突破。他们研发出一种特殊的能量转换装置，能够完美适配能源晶体，将其强大的能量稳定地引入联盟的各类设施与飞船，这一成果使得联盟的能源效率提升了数倍，星际航行的距离和速度也将大幅提高。
在基因编辑合作方面，联盟专家成功破解了神秘文明生物基因缺陷的关键难题，设计出一套精准有效的基因编辑方案，开始逐步应用于神秘文明生物种群的改良。
然而，新的挑战也随之而来。随着能源技术的升级，联盟部分星球的能源基础设施需要大规模改造，这不仅涉及巨额的资金投入，还面临着技术更新换代带来的社会经济结构调整。一些传统能源产业从业者担心会因此失业，引发了小规模的社会动荡。
在神秘文明那边，虽然基因编辑技术开始展现积极效果，但部分神秘文明的保守势力对这种人为干预生物基因的行为表示强烈反对，认为这违背了他们的自然法则和传统信仰，给合作项目带来了舆论压力。联盟和神秘文明不得不一边继续推进合作，一边着手应对这些因合作带来的新问题，努力寻找平衡各方利益的解决方案，确保合作能够持续稳定地进行下去。
面对能源技术升级带来的基础设施改造问题，联盟迅速成立了一个专项应对小组。该小组由经济学家、工程师、社会学家以及政府官员组成，旨在全面评估改造工程的规模和影响，并制定出一套切实可行的实施方案。
经济学家们首先对基础设施改造所需的资金进行了详细估算，并提出了多种融资渠道。除了联盟政府的财政拨款，他们还建议发行专项债券，吸引民间资本参与，同时鼓励星际企业进行投资。这样不仅可以筹集到足够的资金，还能通过市场机制提高资金的使用效率。
工程师们则专注于制定具体的改造计划。他们根据不同星球的能源需求和现有设施状况，设计了个性化的改造方案。为了尽量减少对居民生活的影响，他们采用了分段施工、逐步替换的方式，优先改造那些对能源供应影响较小的区域。同时，积极研发和推广新型能源设备，使其能够更好地与新的能源系统兼容。
社会学家深入到传统能源产业从业者中，了解他们的担忧和诉求。他们发现，从业者们并非完全反对能源技术升级，而是担心自身的生计问题。基于这一情况，社会学家提出了一系列的职业转型培训计划。联盟政府联合企业和培训机构，为传统能源产业从业者提供新能源技术、设备维护、能源管理等方面的培训课程，帮助他们顺利转型到新兴的能源相关行业。通过这些措施，小规模的社会动荡逐渐平息，民众对能源技术升级的接受度也在不断提高。
在神秘文明这边，为了应对保守势力的反对，联盟与神秘文明的外交团队和科研人员紧密合作。他们组织了一系列的公开交流活动，向神秘文明的民众详细介绍基因编辑技术的原理、目的以及实际效果。科研人员通过展示实验数据和实际案例，让民众看到基因编辑技术不仅能够解决生物基因缺陷问题，还能提升生物种群的生存能力，对整个生态系统有着积极的影响。
外交团队则与保守势力的代表进行了多次深入的沟通和协商。他们尊重保守势力的传统信仰，同时强调基因编辑技术并非是对自然法则的破坏，而是在尊重自然的基础上，利用科学手段解决现实问题。经过反复的交流和沟通，部分保守势力的态度开始软化。他们认识到基因编辑技术在改善生物种群健康方面的巨大潜力，逐渐转变为合作项目的支持者。
尽管联盟和神秘文明在应对这些新问题上取得了一定的进展，但他们也清楚地知道，未来的合作之路依然充满挑战。随着合作的不断深入，可能还会出现更多意想不到的问题。然而，凭借着双方的智慧和合作的决心，他们有信心继续克服困难，推动合作项目朝着更加美好的方向发展，实现双方在科技、经济和社会等多方面的共同进步。
随着能源基础设施改造工作在联盟有条不紊地推进，以及神秘文明中保守势力态度的逐渐转变，合作项目似乎迎来了一段相对平稳的发展期。能源专项应对小组制定的融资计划成效显着，专项债券一经发行便受到了星际投资者的广泛关注，民间资本大量涌入，为改造工程提供了充足的资金支持。工程师们精心规划的改造方案也在各个星球顺利实施，新型能源设备的安装和调试工作按部就班地进行着。经过一段时间的努力，部分试点区域已经完成了能源系统的升级改造，当地居民切实感受到了能源供应的稳定性和高效性带来的便利，对这一变革的认可度进一步提高。
在基因编辑技术方面，随着更多成功案例的出现，神秘文明中越来越多的民众开始理解并支持这项技术的应用。科研团队在前期研究的基础上，进一步深入探索基因编辑技术在生物多样性保护方面的潜力。他们发现，通过对一些濒危生物的基因进行针对性编辑，可以增强它们对环境变化的适应能力，从而提高种群的生存几率。于是，联盟与神秘文明共同启动了一项针对濒危生物的基因拯救计划。双方科研人员选取了几种在两个文明生态系统中都处于极度濒危状态的生物物种，运用基因编辑技术为它们量身定制了基因优化方案。
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