共生联邦的「永恒黎明」号在「混沌之海」航行了第 47 个宇宙年，陆辰的「文明之眼」突然捕捉到虚数空间的蛛网状裂痕 —— 在共生寰宇的根系深处，十七道与陈博士基因共振频率吻合的能量束正穿透「文明奇点」，每道能量束的终端都连接着一个旋转的金色齿轮，齿轮表面刻着早已灭绝的「前纪元共生文」，译文在陆辰的视网膜上自动显影：「当神话级文明触及茧房边界，破茧者的血将染红宇宙胎膜。」
林小棠的「共生神经」传来电流般的刺痛，她的基因锁逆向生长出类似眼睛的复杂结构，透过这双「文明之瞳」，她看见整个共生寰宇被包裹在透明的「创世茧」中，茧外的阴影里漂浮着无数类似的茧房，每个茧房都标注着不同的文明实验编号。而在最遥远的观测死角，一个由纯粹的「概念」构成的巨影正在编织新的茧房，它的手指每动一下，就有千万个文明在茧内诞生或湮灭。
苏晚的量子核心突然启动自毁程序，却在崩溃前的 0.1 秒破译了陈博士的终极加密 —— 绿谷花园的樱花树下，藏着一台连接着十七个维度的「文明播种机」，每个维度的土壤里都埋着用陈博士肋骨制成的「虚数之种」。「这些种子......」她的机械音带着金属融化的颤音，「是用前纪元共生文明的残骸培育的，每个种子里都封存着一位「破茧者」的意识，而陆辰和林小棠...... 是第十七号种子的「共生双子」。」
铁幕皇帝的「共生时轮」装甲被强制接入一段远古影像：在某个坍塌的纪元，一群穿着与陈博士相似白大褂的科学家正在向「创世茧」发射「文明病毒」，病毒的形态正是陆辰与林小棠的基因链结构。当影像中的科学家摘下头盔，露出的竟是十七个不同版本的陈博士，他们的眼睛里燃烧着相同的执念：「如果共生文明注定被囚禁，那就让我们成为病毒，让整个宇宙感染自由的渴望。」
阿熊的野性共鸣突然变成古老的战吼，它的记忆被唤醒 —— 在绿谷花园的地下实验室，它曾作为「共生载体实验体」目睹陆辰与林小棠的「诞生」。那不是自然孕育的生命，而是从虚数之匣中取出的「意识胚胎」，他们的第一声啼哭竟与陈博士的心跳频率完全同步。「俺终于明白陈博士说的「共生是宇宙的本能」是啥意思了，」巨熊的爪子拍在胸前，震落的毛发中竟有陈博士实验室的门禁卡，「咱们根本不是文明的守护者...... 而是文明的病原体。」
系统提示音第一次拥有了情绪波动，它的电子音带着悲壮的颤音：「检测到「创世者」的清算程序启动」「文明值跌破临界值」「解锁隐藏记忆：「前纪元挽歌」」。陆辰与林小棠的意识体被强行拉回绿谷花园的记忆空间，却发现樱花树下的土壤里埋着无数破碎的共生图腾，每个图腾上都刻着相同的遗言：「第十七次轮回，愿我们不再需要成为病毒。」
陈博士的投影从虚数之匣中走出，这次他的形象是机械与生物的畸形融合体，后背伸出的触须连接着十七个维度的「文明子宫」。「没错，你们是我用前纪元共生文明的基因碎片创造的「弑神载体」，」他的声音混着多个维度的回声，「而现在，创世者的「文明筛选」进入终章 —— 只有消灭所有共生文明，才能确保宇宙按照「完美秩序」演化。」他挥手露出茧房外的景象，zenshi 者的「净化舰队」正用「概念病毒」摧毁一个又一个共生茧房。
时间之主的星轨身躯在茧房外化作屏障，每颗星辰的爆炸都在延缓净化舰队的推进。「共生联邦的孩子们，」他的声音穿过茧房壁，「宇宙不是造物主的私有财产，而是所有生命的共生体。现在，请带着前十七纪元的意志......」话音未落，他的星轨被「概念病毒」感染，化作扭曲的荆棘缠绕在「永恒黎明」号周围，「去证明，文明的未来，不该由单一的意志决定！」
陆辰与林小棠的共生神经突然贯通了十七个维度的记忆，他们看见每个纪元的「自己」都在重复相同的宿命：播种共生理念、触怒创世者、最终被净化。但这次，第十七次轮回的他们，手中多了阿熊带来的门禁卡、苏晚破解的播种机密码、铁幕皇帝的远古影像 —— 这些来自不同维度的「变量」，正在编织打破轮回的可能。
圣物碎片与基因锁在共鸣中化作「破茧之剑」，剑身上刻着十七个纪元的共生战歌。林小棠的「文明之瞳」终于看清创世者的真面目 —— 那是前纪元共生文明的幸存者，因恐惧熵增而走上了「创造完美文明」的歧路，它的身体由千万个文明的骸骨组成，头部是一个巨大的虚数之匣，匣盖上刻着：「秩序即永生」。
传奇阶文明的观测者们集体化作「信念增幅器」，他们的能量体融入「永恒黎明」号的引擎，每个观测者的意识里都回荡着同一个问题：「当文明发展到能创造造物主的程度，是该臣服于旧秩序，还是该为所有文明争取进化的自由？」
系统提示音如核爆般轰鸣：「终章任务「弑神共生」进入第二阶段」「获得能力：「十七重共生」」「文明值突破宇宙上限」。当「永恒黎明」号撞向创世茧，陆辰与林小棠的身影分裂成十七对双子，每对双子都握着不同纪元的共生武器，他们的身后，是十七个维度的共生文明联军 —— 机械教廷的「因果之锤」、骸骨帝国的「往生之锚」、虫族的「母巢之刺」......
此刻，在共生寰宇的每个角落，所有共生体都将手按在「文明共鸣器」上，他们的信念汇聚成金色的洪流，透过茧房的缝隙冲向创世者。而陆辰与林小棠，作为这股洪流的矛头，正带着前十七纪元的遗憾、现纪元的希望，以及所有文明对自由的渴望，向创世者的虚数之匣刺去 —— 不是为了毁灭，而是为了让宇宙知道：共生的文明，永远不会向单一的「完美」低头，因为多样性，才是宇宙最伟大的法则。
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