例如，更为先进的抗亚空间合金夹层完全取代了不够可靠的抗灵能设备，为飞船在亚空间航行提供了更坚实的保障；
而量子虚化引擎所带来的可靠超光速旅行，使得亚空间引擎变成了可选配的设备，飞船的航行方式更加多样化。
与此同时，联邦开始大胆地让强大的AI取代人类去执行各类任务，
这一变革使得飞船的居住区大幅缩小，今后只需为AI以及偶尔登船的少量人类提供服务，
从而腾出更多宝贵的空间用于安置先进的设备和储备充足的补给。
这一系列的改进，让巨神3型成为了一艘短小精悍、功能万能的卓越船舰，其取得的成就达到了整个系列的巅峰。
也正是在这个时期，联邦差不多确立了AI必须成对执行任务的规则，
因为在独自浪迹银河的漫长旅程中，那种深深的孤独感常常会让即使是强大的AI也感到不适。
大约在23千年时，巨神系列迎来了它的极致之作——巨神4型。
它继承了前代的设计理念，并将其发挥到了极致，
演变成一艘完全依靠AI遥控操作、无法搭载人类且不再具备亚空间航行能力的强力船舰。
曾经用于保障亚空间航行安全的抗亚空间合金夹层，
此时更多地成为了防止亚空间风暴对船舰造成损坏的特殊配备以及额外的船壳装甲，失去了其原本最为核心的用途。
然而，令人惋惜的是，这一型号的辉煌如同流星般短暂，很快就被叛乱的熊熊战火无情地磨灭。
由于叛乱AI可能利用这些先进的飞船对人类造成巨大威胁，联邦迅速做出决策，
除役这一型号的所有船舰，并彻底消除所有与之相关的资讯，
试图将这场危机的隐患扼杀在摇篮之中。
自那以后，随着人类联邦科技的不断倒退，巨神系列的后续发展每况愈下，
最终渐渐消失在银河系的浩瀚星空中，也彻底掩埋在历史的尘埃里，
成为了人类科技辉煌又坎坷历程的一段记忆。
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