后来何夔被征召返回，参与丞相军事。海贼郭祖在乐安、济南边界劫掠，州郡深受其苦。曹操因何夔此前在长广郡有威信，任命他为乐安太守。何夔到任数月后，各城的贼寇都被平定。
何夔后来入朝担任丞相东曹掾，向曹操进言：“自战乱兴起以来，各项制度初创，用人时未能深入考察其本质，因此各自引荐同类之人，忽视了道德标准。我听说，根据贤德授予爵位，百姓才会重视道德；根据功绩授予俸禄，百姓才会勤奋建功。我认为今后用人，必须先在乡里进行核查，使长幼顺序分明，不得逾越。彰显对忠直者的奖赏，明确对公正实在者的回报，那么贤能与不肖之人的区分，自然就会清晰了。此外，还可修订保荐人才不实的法令，让主管部门承担连带责任。在朝大臣中，有时接受诏令参与东曹选拔的，应各自承担选拔责任。这样上可观察朝臣的节操，下可堵塞争权夺利的源头，以此督促百官、引领百姓，如此则天下幸甚。”曹操称赞他说得好。
魏国建立后，何夔被任命为尚书仆射。（《魏书》记载：当时丁仪兄弟正受宠信，丁仪与何夔关系不和。尚书傅巽对何夔说：“丁仪与你已势同水火，你与毛玠交好，丁仪等人已害了毛玠。你应当对丁仪稍微退让！”何夔说：“行不义之事只会害了自己，怎能害别人？况且心怀奸佞之人，在圣明的朝廷岂能长久立足！”何夔始终不屈服，丁仪后来果然因凶诈虚伪身败名裂。）
曹丕被立为太子后，朝廷任命凉茂为太傅，何夔为少傅，特意命令两位师傅与尚书东曹共同选拔太子和诸侯的属官。凉茂去世后，何夔接替他担任太傅。每月初一，太傅入朝拜见太子，太子要穿戴正式礼服以礼相待；其他时间则没有专门的会见礼仪。
何夔升任太仆时，太子想与他辞别，提前准备了宴席，但何夔并无前往之意。太子于是写信邀请，何夔以国家有固定制度为由，最终没有赴约。他坚守正道到了如此程度。不过在崇尚节俭的时代，何夔的生活却最为奢华。
魏文帝曹丕即位后，封何夔为成阳亭侯，食邑三百户。何夔患病后，多次请求退位。曹丕下诏回复：“礼遇贤才、亲近旧臣，是帝王的常事。从亲近角度看，你有辅佐的功勋；从贤能角度看，你有淳厚坚贞的美德。有阴德者必有阳报，如今你虽疾病未愈，但神明定会保佑你。请你安心休养，以顺朕意。”
何夔去世后，谥号为靖侯，其子何曾继承爵位。咸熙年间，何曾官至司徒。（《干宝晋纪》记载：何曾，字颖考。正元年间担任司隶校尉。当时毋丘俭的孙女嫁给刘氏，因怀孕被囚禁在廷尉府。她的母亲荀氏，被武卫将军荀顗上表救免。荀氏获释后，前往廷尉府，请求成为官婢以赎女儿性命。何曾让主簿程咸拟议，程咸建议：“大魏承继汉的弊端，尚未来得及改革制度。之所以追溯诛杀已嫁出的女子，本意是想灭绝丑类家族。但女子若已生育，就成为别家的母亲。从防范角度看，不足以惩戒奸乱源头；从情感角度看，会伤害孝子之心。男子不因其他家族获罪，而女子却要在两家受戮，这并非怜惜女弱、公平法制的大义。我认为，未出嫁的女子可随父母受刑，已出嫁的女子应随夫家定罪。”朝廷采纳了这一建议，于是制定为法令。《晋诸公赞》记载：何曾以高雅着称，加上天性纯孝，官至太宰，封朗陵县公。八十多岁去世，谥号元公。其子何邵继承爵位。何邵，字敬祖，才识深博，有治国的器量风度，官至太宰，谥号康公，其子何蕤继承爵位。何邵的庶兄何遵，字思祖，有才干，年轻时担任清要官职，终老于太仆之位。何遵之子何绥，字伯蔚，也以干练着称，永嘉年间任尚书，被司马越杀害。《傅子》称赞何曾与荀顗：“能用文王之道侍奉亲人的，大概就是颍昌何侯与荀侯吧！古代有曾参、闵损，如今有荀顗、何曾。在内尽心侍奉亲人，在外推崇礼让对待天下。孝子是百世的楷模，仁人是天下的典范。能践行仁孝之道者，堪称君子的表率。”）
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