在官场立威并稳固了自己的根基之后，吕惠卿开始办他的正经事，而这件事其实才是他新官上任后最为上心的事。
简单说，变法派这时候出了大问题，用变法派内部人士的话来说就是变法派内部出了“叛徒”。王安石当时因为两宫太后对神宗的哭谏以及郑侠的事而焦头烂额，所以也就没工夫处理这事，吕惠卿现在就要代王安石“清理门户”。
说到这事我们就得先行提到变法派内部的几位大佬，这些人分别是：薛向、曾布、吕嘉问。
作为前宰相吕夷简的孙子，吕嘉问这时候虽然因为之前的“家贼”事件而被整个吕氏家族所不容，但作为变法派的骨干和王安石变法学说的忠实信徒，吕嘉问早就混得是风生水起。他这时候是“都市易务”的最高长官（提举市易司），市易法就是由他在负责统筹和执行。
在吕嘉问之上，他的直接上司是三司使薛向，但作为世家子弟且又备受王安石的器重和欣赏，年轻气盛且又心高气傲的吕嘉问根本没把薛向放在眼里。况且，他主管的市易务名义上归三司管辖，但实际上它直属于中书省的管辖，吕嘉问有事从来都是直接找王安石商量。在吕嘉问心里，他有一天终将取代薛向继而掌握帝国的财权和经济管理权，而且他也相信自己绝对会比薛向干得更好。
千盼万盼之下，吕嘉问终于等来了机会。由于辽国人这会儿突然提出要重新划定宋朝和辽国在山西的边境，这让宋朝感觉到了战争威胁的再次降临，为此薛向被派去了定州主持大局以备边患。如此一来，三司使的宝座就空缺了，吕嘉问这时候自然是心跳加速小脸通红。可是，王安石最后安排接替薛向的人竟然是曾布，这可把吕嘉问给气得够呛。他气的不是领袖王安石偏心，而是气曾布竟然可以凌驾于自己之上。曾布之前主管司农寺，青苗法和免役法等重要新法都是由他在主理，吕嘉问就觉得自己和曾布本来是同级，可这会儿曾布倒成了他名义上的顶头上司，他咽不下这口气。
公正地说，吕嘉问的不服气还真的有些不自量力。在王安石的心里，变法派的这些人都是有排名的，吕惠卿当仁不让是他的头号干将，薛向、元绛和曾布三人可谓是不分高下，在这之后或许才能轮得到他吕嘉问。事实上，这些人无论是资历还是工作能力都要压过吕嘉问一头，但奈何世家子弟天性骄傲且处处都自觉高人一头，吕嘉问对曾布那是打心里头有一万个不服。
曾布也不是个好惹的主儿，他可不像薛向那么能忍，薛向可以容忍吕嘉问的种种轻慢和放肆之举，但曾布绝不惯这毛病，二人之间就此是暗自成仇。不过，有王安石这尊大佛镇着，二人内心的恶魔都还不敢蹦跶出来。
反过来，曾布这会儿虽然当了三司使，可他也有不服的人。谁啊？吕惠卿！
曾布的骄傲绝不弱于吕嘉问，原因也很简单——万般皆下品，惟有读书高。自古文人相轻，这类人有几人会真心实意地崇拜或臣服于谁？曾布就是这里面最典型的例子。吕惠卿和他都是同年进士（嘉佑二年的龙虎榜成员），只不过他接近王安石要比吕惠卿晚，可他自认为他的本事绝不比吕惠卿差。
历史也给了曾布为自己正名的机会，青苗法实施之后，吕惠卿因为母丧回家守孝，曾布则趁机取代了他的职位。当吕惠卿三年后再度归来时，他发现曾布几乎在各个方面都超越了他，简单说就是曾布在吕惠卿所制定的各项新法条例上都做了升级和补充性修改。换言之，吕惠卿之前的所有成绩似乎都是在为曾布做嫁衣。吕惠卿表面上咯咯直笑大力夸赞曾布，但实际上却是牙根紧咬，曾布也由此建立起了对吕惠卿的自信：我就是要比你强那么一丢丢！
让曾布也感到沮丧的是（同吕嘉问一样的心理），王安石对吕惠卿的赏识和重用依然如常，这三年里他的付出还是没能让他取代吕惠卿成为王安石的头号护法大神。这时候的吕惠卿已经是翰林学士了，离两府大臣就差一步，可他曾布却依然只能活在吕惠卿的阴影之下。没错，你曾布确实完善了吕惠卿制定的新法，看上去你似乎比吕惠卿能干，可从另一个角度上来说你不就是一条寄生虫吗？于是，生性好强的曾布不但下打吕嘉问，而且还上揍吕惠卿。
当然，我们也说了，因为有王安石在，所以变法派内部的这些矛盾和争斗都还只是平静水面之下的一股暗涌。让这份暗涌开始掀起浪潮的正是这年三月神宗皇帝因为旱灾而下达的那份罪己诏和求言令，变法派的叛徒这时候也跳了出来，这个人是谁呢？答案绝对让你感到意外——曾布！
纵观曾布的官宦生涯你会发现一个奇怪的现象，变法派当政时他是大官，保守派复辟后他也是大官，后来变法派也复辟的时候他更是当了宰相。这是一个什么样的物种？他到底是哪边的？这是一个让新旧两党都搞不清楚的问题，但旧党最后给他盖棺定论时还是把他归为变法派并把他的名字写在奸臣传的名单里。然而，这样的一个让保守派所不齿的人也让变法派对其恨之入骨，因为他后来在关键时刻又一次地充当了新党叛徒的角色——哲宗驾崩之后，曾布临阵倒戈转而拥护向太后把赵佶给推上了皇帝的宝座。往大了说，北宋灭亡他曾布也得背锅！
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