在布局很久之后，萧耨斤某天终于是对萧菩萨哥下了死手，她通过暗中安插在萧菩萨哥身边的一位太监得知了萧菩萨哥的一个秘密，那就是喜欢声乐的萧菩萨哥暗中与两名善弹琵琶的乐工私通。此事真假存疑，但可以确定的是，萧耨斤指使这名太监去向耶律隆绪告发此事，还说会为这个太监在背后撑腰。
于是，某天耶律隆绪就在自己的床上看到了一封匿名揭发萧菩萨哥不守妇道的举报信。可是，耶律隆绪的反应却是出乎萧耨斤的意料，他一口断定这就是萧耨斤在故意陷害萧菩萨哥，所以也就未对此事做任何处理和回应。
这可把萧耨斤气得要死，而逃过一劫的萧菩萨哥转而就准备把隐藏在自己身边的这个奸细给干掉，可她却发现这个名叫赵安仁的太监因为害怕神仙斗法会殃及自身，所以早就已经偷偷跑了。可惜的是，以萧菩萨哥的势力想抓一个逃犯还是不难的，赵安仁被抓了回来，眼看就要被处死，可萧耨斤怎么能放过这样一个可以跟萧菩萨哥一决高下的机会。在她的说情下，赵安仁保住了小命，这回就又轮到了萧菩萨哥被气得要死。
此事一出，两个萧妹妹的矛盾就此公开化，双方都想置对方于死地而后快，而这时候的耶律隆绪已经是病入膏肓。在知道自己离死不远后，耶律隆绪特意嘱咐自己的儿子耶律宗真：“皇后与我有着四十年的夫妻情分，而且她也抚养了你长大成人，朕死之后，你和你的生母切不可加害于她，更不得杀了她！”
我们从耶律隆绪的这番临终遗言里已经可以很明显地感受到他对辽国未来朝局的担忧，也可以看出萧耨斤家族的势力已经明显超出了萧菩萨哥的家族。在自己行将驾崩之前，耶律隆绪为自己年少的儿子选定了三位辅政大臣，分别是：时任东京留守的萧孝穆、上京留守萧孝先以及左丞相张俭，同时他还特别告诫此三人以及皇太子耶律宗真切勿背弃与宋朝的和平盟约。此外，耶律隆绪还留下了一道遗诏：命耶律宗真继承皇位，萧菩萨哥为皇太后，萧耨斤为皇太妃。
做完了这些事之后，耶律隆绪这才带着对帝国前途和命运的担忧蹬腿走人。不幸的是，他还留有最后一口气的时候，他的小老婆萧耨斤就已经起飞了。作为即将登基称帝的耶律宗真的生母，萧耨斤直接跑到自己的政敌和情敌萧菩萨哥的面前指着对方的鼻子破口大骂：“老贼妇，你的好日子就要到头了，等到陛下驾崩以后，我看还有谁能够罩着你！”
借由家族势力的支持，在耶律隆绪前脚蹬腿走人之后，萧耨斤后脚就把耶律隆绪的遗诏扔在一旁。她先是把自己的儿子耶律宗真扶上了辽国皇帝的宝座，然后直接自立为辽国的皇太后并摄理军国政务，然后她便开始了对萧菩萨哥以及其家族的大清洗。
在耶律隆绪选定的三位辅政大臣中，东京留守萧孝穆、上京留守萧孝先可都是萧耨斤家族的人，这也就注定了萧菩萨哥的下场和结局。在他们的密谋和授意下，辽国北府宰相萧绰卜以及辽国驸马萧匹敌被自己的家仆揭发欲行谋逆之事，这些人指控他俩准备拥立萧菩萨哥为皇太后并重新选定他人当辽国皇帝。
不用我在这里多说相信大家也都能猜得出来，这个萧绰卜和萧匹敌都是萧菩萨哥家族的人，前者是萧菩萨哥的堂兄弟，而后者更是萧菩萨哥的亲弟弟，而萧匹敌的老婆则是萧耨斤的大女儿。也就是说，身为萧菩萨哥的亲弟弟，可萧匹敌的另一个身份则是萧耨斤的女婿。辽国皇室的血缘和亲属关系是一张足以杀死海量脑细胞的巨型且纷杂难理的蜘蛛网，简单说就是近亲结亲，亲上加亲。结果就是一堆人杀来杀去，大伙儿其实都是一个窝子里的人，要是攀起关系来全都是亲戚。
以谋逆为由，萧耨斤下令缉捕萧绰卜和萧匹敌并下狱审讯。公元1031年6月25日，萧绰卜和萧匹敌等七人以谋逆罪被当众诛杀，而在他们的“供状”里也将萧菩萨哥给牵连了进去。萧耨斤的意图很明显，她的下一个要拿来开刀的人正是萧菩萨哥。可是，出于种种原因和考量，萧耨斤还是暂时放下了屠刀，她饶了萧菩萨哥一命，最后只是命人将萧菩萨哥软禁在了辽国的上京（今内蒙古巴林左旗林东镇，如今这里只剩下了一处遗址）。
得知此事，手中毫无任何实权的小皇帝耶律宗真出于对萧菩萨哥多年养育之恩的感念便前来说情：“先皇后侍奉父皇多年且抚养我长大，这个太后之位也本来应该是她的，如今她不但失去了太后之位，母后你还要将其软禁起来，这样做恐怕不好吧？”
见自己的儿子竟然替仇人说情，萧耨斤顿时火冒三丈，她大怒道：“此人不除，必为后患，你老娘我迟早要死在她的手里！”
耶律宗真还是不打算放弃，他再又说道：“她又没儿子而且年纪也大了，留着她又能有什么威胁？难道我还不能保护你吗？”
这一次萧耨斤直接不再搭理自己的儿子。你个小屁孩懂什么？况且，老娘我现在是皇太后，整个辽国我说了算，你给老娘我滚一边待着去！
次年三月，耶律宗真御驾出行前往辽国上京进行例行的春季围猎。由于担心儿子会在见到养母之后大发慈悲并解除对萧菩萨哥的软禁，萧耨斤便暗中派人秘密前往萧菩萨哥的处所将赐其死。
面对死亡，曾经在辽国母仪天下的萧菩萨哥极其镇定地对使者说道：“我本无罪，此乃天下共知，你们想让我死不是不可以，但能否待我沐浴更衣之后？”
使者默然，然后退出。等使者再行复入之时，萧菩萨哥已然自尽而亡，时年还未满五十岁。
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