却说王敦进了石头城，晋元帝痛感大势已去，便下旨命六军解兵，并急召太子入宫。太子受召，偕太子中庶子温峤来见。元帝恐太子受伤害，遂命温峤保其驾出奔江北投郗道徽。
郗道徽者，高平郗鉴也，乃徐兖流民帅之盟主，其时以徐兖二州刺史镇广陵。晋元帝痛感走投无路，自身虽不惧王敦逼宫，大不了死社稷，但想到太子不能死，太子若死，则大晋亡矣！于是便想到让他出奔广陵避难，而郗鉴必能保太子周全。
温峤却道：“大将军可有章奏？作何言语？”
元帝道：“并无。”
温峤沉吟道：“为今之计，当镇之以静！大将军既无奏章，我当知其意！臣请立赴石头城！”
元帝道：“卿——何意？何以此刻——尚赴石头城？”
温峤道：“昔年我奉旨衔使武昌，与大将军论及北事，相谈甚欢。大将军景仰刘司空之情，溢于言表！今其虽率大军犯阙，恐其中另有曲折！陛下若信臣，予臣犒师圣旨一通，我携赴石头城，与之一晤，便知究竟！”
元帝沉吟，以温峤任职东宫为太子中庶子，乃太子心腹之臣，王敦若见其携犒师圣旨至，必能了知至尊心意，又觉温峤甘冒大险实属难得，于是应允。温峤遂携元帝劳军圣旨，到了石头城王敦军中。
王敦见了温峤大喜，呼其表字道：“太真！太真啊太真！寡人在此间，日盼到晚，只道太真何以尚不至！”
温峤道：“逆贼沈充突至秦淮水南，扬言烧朱雀大桁！在下欲请旨与之决战，陛下却道，‘沈充跋扈，必非大将军之意！今大将军既已亲临石头，当遣卿宣旨慰劳。沈充犹大将军一犬，为主吠人耳！当请大将军命其退去。’陛下复从容道，‘沈充小丑作乱耳，大将军必是勤王之师！今大将军既已入石头城，复何忧哉！卿且饮酒，待圣旨草成。’峤本不胜酒力，陛下兴致颇高，频频举杯，在下不得已，乃陪饮至晡时。因此耽搁时辰，是以来迟！”
王敦听了温峤自编的元帝言语，半信半疑，看罢圣旨，也是温言劝慰，心中因元帝重用刘隗，用其言发僮客为兵，且排斥族弟王导而起的怒火，不禁息了大半，于是道：“陛下圣明！我即命沈充退兵。”
温峤道：“刁、刘已逃去，否则陛下当命峤缚之来见！”
王敦嘿嘿冷笑，道：“不须刁刘，有卿太原温太真，一人足矣！”
温峤大惊，不知王敦何意，乃道：“在下无罪！”
王敦哈哈大笑，道：“岂止无罪，太真有大功于天下！全陛下与我君臣者，温太真也。”
王敦说话算话，即命沈充退了兵，但却以罪为功，上书称，“沈充激于刘隗强征僮客为兵，行苛碎之政，是以举兵，其所为者清君侧、诛残贼。今残贼已北走，沈充之功也！充原任宣城内史，宣城多山而远离沈氏籍里吴兴，今特请迁充为吴国内史，以慰功臣劳苦！”元帝不敢违拗，即以沈充为吴国内史。
吴国内史吴郡张茂以沈充为叛逆反贼，不愿让位。沈充便率军袭杀张茂，夺取了吴国内史之位。
二
即位之年暮春，晋明帝即带同几名禁卫骑兵，至芜湖刺探了一番王敦军情，并得知敦已病重。明帝回都，料想王敦必不善罢甘休，便着手准备，欲先发制人，以上年王敦率军犯阙为由，西征芜湖。
王敦既病重，只能以其兄王含为元帅，而含实非将才，幸参军吴兴钱凤颇晓军事，于是庶务一委钱凤。
沈充既转吴国内史，吴郡富庶，甲于江东，沈充又为自身及其吴兴沈氏别支谋得了不少佃客，沈氏更加强盛。自钱凤处知王敦将发动二次犯阙，且此番必代晋称帝，于是他且一面自佃客中秘密招兵，部曲达二万人。
晋明帝既知王敦病重，而代统其荆州兵之王含非将才，得知大军东下，便命将出师，迎击于江上。王含一触即溃，西逃至姑孰。幸钱凤收拢残部，屯于江渚，尚可待机再战。
沈充既得钱凤信，知芜湖已发动，便率军入太湖，直趋破岗渎，扑向建康。不想此番江北诸流民帅各率军大至，尤其长广苏峻与范阳祖约，各率部曲，自东西两面夹攻沈充军。充军为苏峻军拦腰截断，遂为苏、祖二军各个击破。
沈充狼狈南走，欲归吴兴。至太湖，将登舟，却闻仇家——前吴国内史张茂妻，召集其亡夫旧部三千人，待于南岸，誓将生擒沈充脔割之，以报张茂为其袭杀之仇。沈充因此，不敢坐船南行，乃自陆路，取道湖西山微行，方将潜至吴兴，却迷失道，误入故将吴儒家。吴儒假意相藏匿，引充入夹壁中。沈充一入，吴儒便大笑道：“今日得君首级，便是三千户侯！”沈充道：“卿能活我，异日必当厚报！若不然者，放我去，仍不失旧谊。若卖我，卿异日，恐有灭门之灾！”吴儒不听，遂杀沈充，献首建康而取侯。
王敦亦死，叛军树倒猢狲散，叛乱很快敉平，钱凤、王含皆死。沈充既为叛贼，其子沈劲，本当一体同戮，赖钱凤族人钱举藏匿得免。然以刑家罪孽，沈劲后虽遇赦，终不能登仕途。大赦因新帝登基而起，沈劲虽可不再藏匿，但罪家遗孽着名乡曲，谁又会在乡举里选时推荐他呢，州郡中正亦避之唯恐不及！于是年至三十，沈劲仍未能出仕，倒是记着吴儒卖父之大仇，一日夜，率家兵突至吴家，灭了吴儒满门。
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