孔有德也知道此时，山东莱胶线的义军已经暴露了，清廷肯定知道这义军都是金州军扶持的，那就名正言顺吧。
通过整编，诸城义军正式加入金州军，暂时编为沂蒙独立营，由孔有德再委派军官打入进行整改。
孔有德暂时还不决定马上回胶州，决定把蒙阴做为此行军事行动的一个成果，成立根据地，对周边的平邑、费城、沂南等县进行渗透，这样连上沂水，根据地和胶州已经连上了，彻底的封住鲁中通道，清军从此在山东只有南北从运河相通了。
孔有德决定就在蒙阴开此次西征总结大会，会议上对本次西征做了全面分析，总结了比较成功的几方面，也总结了几次陷入被动的原因，再总结了运动歼灭战和山地战的特点，对作战人员也进行了嘉奖，也确定了今后的发展方向。
孔有德同时从胶州派来大量文职人员，对根据地的地方民政进行梳理，吸收大量失地农民及流民加入，目前沂蒙金州军大概一万人，留下王子登和王觉远留守，加上民众近十万人，基本上稳定下来了。
张国兴的水师在孔有德后撤后直接向北而去，让运河西岸的清军搞不懂，双条腿也追不上带帆的船，最后运河西岸的清军只能向济南报告金州军水师动向。
张国兴却没有直接北上插入黄河，据他的了解，黄河的河道虽然宽，但是水深却是个问题，大部队前行，万一搁浅了，就会成为活靶子，索性一头扎进东平湖。张国兴就带着主力舰船在湖里兴风作浪，偶尔上岸对东平城洗劫一番，旋即又回到湖上，清军无可奈何。张国兴又派剪刀船沿着小清河在黄河下游进行探查路线，反正孔有德给的命令是年前回到胶州就可以了。
张国兴在湖里折腾了十来天，剪刀般探回来消息让他感觉不太美妙，他得可以行动了。因为现在已经是十一月天了，黄河早就进入了枯水期，幸好今年的黄河上游雨水比较多，此时下游的水量还是很足，风帆战船吃水没什么问题。如果真是等到寒冬腊月天，水面结冰了，那就可以惨了，水路不通，除了南下别无他法，但是南下什么情况还不好说。
十一月底，天气已经有些冷了，天还没有亮，湖面上笼罩着浓浓的雾纱，金州军五十来艘舰船从小清河直插黄河。
平阴县居然组织了不少渔船企图阻止金州军水师东进，结果可想而知，金州军一阵炮击过去，全部变成了碎片散落在河上。
金州军的意图很快被清军探知，原来金州军不是沿运河北上突袭北京，应该是想从黄河突入海中。很快，济南方面做出应对措施，绝对不能让这支害人的金州水师回去，一定要扼杀在黄河上。
清军在济南黄河的两岸均设置炮台，济南城头也放置了多门红衣大炮。丁文盛亲自做了总动员，济南此时还有五万清军集结，兵力还是很充足的，不担心这几千金州军把济南拿下来，但是担心突袭，把丁文盛抓了就麻烦了，所以丁文盛做了几种预案。
其中还在怀庙到盖家沟的水域上，设置了大量的水障，就是把木头用绳子捆起来，连成一片，两岸由专人来回拉动，一旦金州水军被这种水障缠上，再放出火船火烧金州水师。
另外还挑选了百余水性极好的士兵，准备在适当的时候潜入水底凿金州水师的船只。
两天后中午，金州水师比预想的来的慢一些，显然金州水师已经探知了济南的准备动作。金州水师临近济南停在黄河上不动了，还陆续派出水军上右岸行动，这下把济南清军搞不明白了，到底想干什么？为了防止金州水师有其它阴谋，济南清军调集了一万步兵，赶到河边对金州军进行围堵。
想不到金州军也是一个时辰的时间就在岸边构筑了一个防御工事，还摆上了十几门红衣大炮。一万清军蜂拥而至，被早有准备的金州从防御工事和河里的舰船自由打击，硬是冲不过来。清军不断的调集步军前来，集结二万多兵马后，慢慢的逼近了金州军阵地，虽然能够形成对金州军的包围了，但是金州军的炮火让清军吃尽了苦头，因为清军属于集结包围，人都挤在一起，金州军放起了开花弹，一炮一大片，战斗进行到天黑，清军也没有能拿下金州军的阵地。
第二天，金州军仍然没有前行意思，还将阵地进行了加固，大有继续耗下来的意思，一个上午过去了，清军还是拿不下阵地。丁文盛考虑再三，决定把右岸和城墙上的大炮全部移过来，他自信的以为金州军不敢向前，就是因为他做足了准备，金州军害怕了，只能以这种方式和济南战斗。等右岸和城头上的火炮都拉过来的时候，天已经快黑了，双方罢战，进行对峙。
第三天，一大早，金州军突然开始向黄河下游挺进，这就出乎了清军的意料，以最快的速度抢占工事，结果工事里空空如也，金州军半夜已经把火炮拆走，临了还在工事里埋了大量的炸药，被闯进来的清军误引爆，炸死了一二百人。
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