在民俗文化方面，清水祖师信仰有着丰富多彩的表现形式，其中最具代表性的当属庙会活动。清水祖师的庙会通常在其诞辰或其他重要纪念日举行，是当地一年中最为热闹的时刻之一。庙会前夕，庙宇内的神职人员和信众们就开始忙碌地准备。他们打扫庙宇、布置祭祀场地、准备祭品等。祭品丰富多样，有水果、糕点、鲜花、三牲等，每一种祭品都有着特定的寓意，如苹果象征平安、橘子寓意吉祥、鲜花代表美好等。
到了庙会当天，天还未亮，信众们就从四面八方赶来。他们身着盛装，手持香烛，怀着虔诚的心进入庙宇。祭祀仪式庄重而肃穆，信众们先在大殿前的香炉中焚香，然后向清水祖师神像行跪拜礼，祈求平安健康、风调雨顺、五谷丰登等。在仪式过程中，还伴有诵经、奏乐等环节，悠扬的佛乐和诵经声在庙宇中回荡，营造出一种神圣的氛围。
庙会期间，除了祭祀活动，还有各种精彩的民俗表演。舞龙舞狮是必不可少的项目，色彩鲜艳的巨龙在人群中翻腾飞舞，狮子则活灵活现地跳跃、翻滚，它们所到之处，人群欢呼雀跃，现场气氛热烈非凡。这些表演不仅增添了节日的欢乐氛围，更有着驱邪避灾、祈求吉祥的寓意。此外，还有踩高跷、扮八仙过海、车鼓弄等表演。踩高跷的演员们脚踩高高的木跷，扮成各种神话人物或历史人物，在街道上行走，仿佛从另一个世界走来。扮八仙过海的表演生动地再现了八仙过海各显神通的故事，演员们的服饰和道具都十分精美，吸引了众多观众的目光。车鼓弄则是一种具有闽南特色的民间舞蹈，演员们边歌边舞，表演诙谐有趣，展现出闽南民间艺术的独特魅力。
除了庙会，在民间还有一些与清水祖师信仰相关的习俗。例如，当遇到干旱之年，村民们会组织祈雨仪式，他们抬着清水祖师的神像巡游，祈求祖师施展神力，降下甘霖。在一些地区，家中有人患病时，信众也会前往清水祖师庙求签问卜，希望得到祖师的指点和庇佑。如果病情好转，还会到庙宇还愿，献上祭品，表达对祖师的感激之情。这些习俗反映了清水祖师信仰在民众日常生活中的深度嵌入，成为人们应对生活困难和寻求心理安慰的重要方式。
从宗教文化的角度来看，清水祖师信仰与佛教有着密切的联系。清水祖师本人是佛教高僧，他的修行和教义深受佛教思想的影响。在庙宇的建筑、祭祀仪式和神职人员的活动中，都可以看到佛教文化的影子。例如，庙宇中的佛像供奉、诵经拜佛等仪式都遵循佛教的传统。然而，清水祖师信仰又具有很强的民间性和地域特色，它在发展过程中融入了大量闽南地区的民俗文化元素，更加贴近百姓的生活实际。与正统佛教相比，清水祖师信仰更侧重于解决民众在现实生活中面临的问题，如自然灾害、疾病、农业生产等方面的困扰，体现出一种实用主义的宗教观念。
清水祖师信仰在社会价值方面有着重要的作用。在古代，闽南地区自然灾害频繁，社会发展面临诸多挑战。清水祖师信仰为民众提供了一种精神寄托和心理安慰，让人们在面对困难时能够保持积极的心态。当遇到大旱、洪水等自然灾害时，民众聚集在祖师庙前祈祷，这种集体的信仰行为在一定程度上缓解了社会的恐慌情绪，增强了社会的凝聚力。而且，清水祖师庙会等活动促进了不同地区、不同阶层的人们之间的交流和互动。在庙会期间，无论是富人还是穷人，都共同参与到庆祝活动中，这种跨阶层的交流有助于打破社会隔阂，促进社会和谐。
在现代社会，清水祖师信仰依然具有重要的价值。从文化价值来看，它是闽南传统文化的重要组成部分，承载着丰富的历史、民俗、宗教等文化内涵。清水祖师庙的建筑艺术、民俗活动中的表演艺术、传说故事等都是闽南文化的瑰宝。通过对这些文化元素的保护和传承，可以促进闽南文化的多样性发展，让后人能够了解和感受闽南古代文化的魅力。例如，可以利用清水祖师庙发展文化旅游，吸引国内外游客前来参观，让更多的人了解闽南的历史文化和民俗风情，同时也能带动当地经济的发展。
从社会价值来看，清水祖师信仰依然在凝聚人心、促进社会和谐方面发挥作用。庙会等活动仍然是当地民众社交和娱乐的重要方式之一，丰富了人们的精神生活。同时，清水祖师信仰所倡导的慈悲、善良、互助等价值观在现代社会依然具有积极的意义，它可以引导人们树立正确的道德观念，促进社会文明的进步。在两岸关系中，清水祖师信仰也是连接两岸同胞的重要精神纽带。两岸同根同源，清水祖师信仰在台湾有着广泛的信众，通过两岸的宗教文化交流活动，如联合祭祀、学术研讨等，可以增进两岸同胞的相互了解和感情，为两岸关系的和平发展创造有利条件。
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