贾后又令李肇通报大司马、汝南王司马亮，让他联合各藩王军队讨伐杨骏。
司马亮说：“杨骏的凶暴行为，会使他很快灭亡，不值得忧虑。”李肇又通报楚王司马玮，司马玮同意这个计划，于是请求入朝。杨骏平素就怕司马玮，早就想把他召回朝中，以预防他搞变乱，因而听任司马玮入朝。
元康元年（291年），司马玮到京城以后，孟观、李肇就上奏晋惠帝司马衷，让他夜间下诏书，宫内外戒严，派使者奉诏书废黜杨骏，让他保留侯爵回府第。东安公司马繇率领殿中卫士四百人讨伐杨骏。段广跪在地上为杨骏求情说：“杨骏受过先帝厚恩，尽心辅政。而且是个无儿子的孤老头儿，岂有谋反之理？望陛下详察。”惠帝没有回答。当时杨骏住在曹爽的故府，在武库以南，听到宫中有变，召集众官商议对策。
太傅主簿朱振劝杨骏说：“现在宫中有变，目的可想而知，必是宦官们为贾后设计谋，将不利于公。应放火烧了云龙门向他们示威，让他们交出制造事端的首恶分子，打开万春门，引出东宫及外营兵为援，公亲自带着皇太子，入宫索取奸人，殿中将会震惊，必然斩杀奸人送出首级，这样才能免于遭难。”杨骏平素就怯弱，此时犹豫不决，却说：“云龙门是魏明帝建造的大工程，怎能一下子烧掉呢！”侍中傅祗夜里告诉杨骏，请他与武茂一起进入云龙门，以观察宫中事态。傅祗又对群僚们说：“宫中不能无人照料。”起身揖拜而去，于是群僚们都走开了。
接着殿中兵出来，烧了杨骏府邸，又令弓弩手上到阁楼上向杨骏府中射箭，杨骏的卫兵都不能出来。杨骏逃到马棚里，被士兵用戟杀死。孟观等受了贾后的密令，诛杀杨骏的亲戚党羽，于是杨珧、杨济、张劭、李斌、段广、武茂、散骑常侍杨邈、中书令蒋俊、东夷校尉文鸯都被诛灭三族，被杀的达数千人。贾后又令李肇焚烧杨骏家中的书信文件，不愿意让天下人知道晋武帝给杨骏的顾 命诏书。杨骏被杀后，没有人敢收尸，只有太傅舍人巴西人阎纂安葬了他。
杨骏被杀，晋惠帝司马衷下诏书说：“大司马、汝南王司马亮体察圣道中和纯正，通晓政理，应当把辅佐的业绩在本朝显现出来，《周南》、《召南》两种国风流芳于中国，要凭借远大的谋略，来褒扬王化。任命司马亮为太宰、录尚书事，入朝不必趋行，并可佩剑穿鞋上殿，增加隶属十人，供给一千士兵一百骑士，与太保卫瓘分掌朝政。”
司马亮议论奖赏诛戮杨骏之功的过失差错，想以此博取众人欢心，因此大失众人所望。
同年（291年），司马玮受皇后贾南风之旨，诬告司马亮与卫瓘有废太子的图谋，假托诏令派长史公孙宏与积弩将军李肇用军队在夜间把他包围起来。帐下督李龙告诉他说外面有事变，请求抵御，司马亮不听从。
一会儿楚王司马玮的军队登墙呼叫，司马亮吃惊地说：“我对朝廷没有二心，为何到这个地步？如果有诏书，可以给我看一下吗？”公孙宏等不同意，督促士兵进攻。
长史刘准对司马亮说：“看此情形一定是奸人的计谋，你府中的俊杰之士如林，尚且可以尽力抵抗。”
司马亮又不同意，于是被李肇捉住，司马亮叹息道：“我的忠心可以剖开来遍示天下，你们为什么如此无道，枉杀无罪之人呢？”
当时天气十分炎热，士兵让司马亮坐在车下，时人可怜他，替他打扇子。将到中午，没有人敢杀。
司马玮就下命令说：“能够杀司马亮的人，赏他一千匹布。”
于是司马亮被乱兵所杀，他的尸体被扔在北门的墙壁下，头发耳朵鼻子都被毁坏。不久，司马玮被诛杀，朝廷追赠恢复司马亮的爵位，供给他东园的温明祭器和棺材，朝服一袭，钱三百万，布绢三百匹，丧葬之礼如同过去的安平献王司马孚一样，庙内陈设钟磬之乐。
元康二年（292年）四月，在杨骏死后，被诛灭三族，导致株连而死的共有数千人之多。晋惠帝司马衷下诏使后军将军荀悝将太后杨芷送往永宁宫，特赦免太后杨芷的母亲高都君庞氏不死，准许与太后杨芷住在一起。
皇后贾南风唆使大臣有司向司马衷上奏说：“皇太后暗地施展奸谋，企图颠覆社稷，箭射帛书，邀集将士，同恶相济，自绝于天，鲁庄公与母亲文姜断绝亲族关系，是《春秋》所赞许的，意在人君应顺承祖宗大业，向天下人表示至公无私。陛下虽有难以遏止的情感，但臣下不能从命，可召集王公们在朝堂议论。”
晋惠帝司马衷下诏说：“这是大事，查清楚再说。”
有司又上奏说：“杨骏凭借外戚资历，居冢宰重任，陛下居丧期间，委以大权，以致图谋篡逆，安插党羽。皇太后与杨骏唇齿相依，协同叛逆，阴谋暴露以后，又抗拒诏命，拥兵恃众，使宫中血刃，而太后又射帛书邀集将士，奖励凶党，上有负于祖宗之灵，下使亿万百姓绝望。昔日文姜参与谋乱，《春秋》加以贬斥；吕雉宗族叛乱，吕后宗庙降位，应该废皇太后为峻阳庶人。”
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