在这次事件之后，亚历山大已经完全陷入了一种低沉和压抑的状态。他的军队驻停在了距离那里不远的帕萨尔加德，他对巴耳馨说：“我从平定海拉斯叛乱以来，到入侵亚洲的整个过程，打着为父报仇的名义所做的所有事，在之前我的内心认为那是绝对正义的；在知道了你和你养父的故事以后，我开始动摇了这个想法。这次在波斯波利斯，无论我出征的借口是否正确，无论这把火是不是我亲自放的，这场大火会被历史铭记，毫无疑问，我是使它发生的最大推动者……“巴耳馨，我的将领和士兵们以为我是为了领土和荣耀而战，而他们之所以跟随我也只是为了财富与地位……”他继续说，“没有人会真的相信我是真的为父亲复仇而战，更不会有人相信我是为了正义和真理而不断地前进着……我太累了，巴耳馨……也许我应该放弃了……向你的养父议和，请他回来继续做阿契美尼德的皇帝，我的将士不会反对，因为他们已经腰揣金银与珠宝，而我将带着我的士兵回到我的故乡去，归还自由给那些被马其顿控制的城邦，然后我将放弃王位，离开那里，云游四海，陪你一起到世界的尽头去寻找世间万物的答案……”“无论你去哪儿，无论你做什么，我都会陪在你身边……亚历山大……”巴耳馨依偎在男人的臂膀，“我要同你一样，放弃祭司的职位，我的妹妹会继承我的职责，而我将和你一起浪迹天涯……”于是，议和信被寄往了北方的埃克巴坦那，但科多曼努斯怎么可能相信那曾经把他逼入绝境的亚历山大会放弃自己的领土和王位，就这样把这个帝国还给他。他并未给出回信，继续在东部召集军队，坚壁清野，希望与亚历山大在北方和东方再次决一死战；于是亚历山大决定亲自前往米底亚，当面向科多曼努斯表明自己的决心和意愿。他的军队开始向西北折返，这让科多曼努斯以为亚历山大开始追击他了，他便向斯基泰人求助，然而在高加米拉战败之后，科多曼努斯的威信已大不如前，斯基泰人并未伸出援手，于是科多曼努斯则渡过了希尔卡尼亚的关口，继续向东逃跑。巴克特利亚总督贝苏斯（Bessus）见自己的皇帝如此落魄，便想取而代之，他连同其他贵族发动政变，将科多曼努斯拘禁；那从贝苏斯处逃出来的，原属皇帝的海伦尼克雇佣军投奔了亚历山大，通知了他这一情况。亚历山大听闻贝苏斯将科多曼努斯挟持，连忙率领骑兵和轻装步兵亲自前往救援，甚至最后连夜急行军。到清晨的时候，一位马其顿士兵发现了被遗弃且已受重伤的科多曼努斯躺在河边，那时他已经濒临死亡，他向马其顿士兵要了一口水喝后，表达了他对亚历山大仁慈对待他家人的感谢，而后逝世。不久，亚历山大亲自赶到现场，他惋惜至极，脱下自己的斗篷来为死去的国王覆上。一场隆重的国葬在帝国的首都举行，按照亚历山大的要求，科多曼努斯被葬在波斯波利斯的帝王陵。之后，亚历山大开始追击僭位者贝苏斯，向科多曼努斯复仇，他率军向东讨伐，进入了帕提亚，然后向南追至阿利亚（Aria）和德兰吉亚那（Drangiana），再向北进入阿拉霍西亚，穿过水之山进入巴克特里亚，并从那里继续向北进入粟特（Suguda）地区。直至极北的可萨提河（Jaxartes）畔，贝苏斯才被亚历山大的大将托勒密逮到，并立即以叛国罪处死。了却这桩心事以后，亚历山大带着他的军队驻扎在粟特以南，巴克特里亚以北的那片草原之上，那里的农舍和小镇恬静惬然，在山峦与草地的映衬下，如仙境般美轮美奂；这里的溪水甘甜，民风淳朴，亚历山大与巴耳馨都被这美好的风光所折服，决定在此住下，他们陷入热恋，终日缠绵，度过了一生中最快乐的一段时间。亚历山大的将领们并不知道亚历山大是在与谁相恋，还以为那是从附近俘虏来的贵族姑娘，紧接着，他们就在当地人的见证下举办了简单的婚礼。当时，巴耳馨用的假名是罗克珊娜（Roshanak）。那段时间，亚历山大忘记了世俗中束缚他的一切：王国、名誉和责任；他忘情于山水之间，快乐而满足。直至他的将领们都表示想要离开这‘野蛮之地’，回到巴比伦去，享受无尽的荣华和受人敬仰的后半生。“是的，我们该走了。至少要先回去安顿好这一切，我们才能离开，否则这个没有国王的国家会立刻陷入混乱……”亚历山大对妻子说，“你能想象吗？我们已经不知不觉到了极东之地，根据传说，只要从这里继续向东，很快就能到达‘世界尽头’了，那里会不会就是大树告诉你的地方，而那里是否真的会有一艘开往‘彼岸’的船呢，我真的很想去看一看……”亚历山大说服了军队，再向西行进不久，便会到达大海，走水路回巴比伦要比向西原路返回要轻松且快速很多，于是，他们继续向东进发，跨过了印度河，进入了未知的世界；他极力的劝说沿路的当地人，他只是想借过他们的土地去到大外海，但他们仍然不停地遭到当地的土着部族袭击。在希达斯皮斯里弗畔的旁遮普（Punjab），当地的酋长波罗斯（Porus）率领大象军团突然攻击了亚历山大的军队，虽然经过苦战，科林斯同盟和马其顿人再次获得胜利，但士兵们已经对这些战象产生了恐惧；当他们从俘获的士兵那里听说继续向东的土地并不是海洋，相反等待他们的仍然是林立诸多部族的雨林，每一个部族都拥有数万头战象的时候，在维帕希河畔（Vipas），亚历山大的几位军官拒绝渡河，直接违抗了他的命令。很显然，亚历山大从未遇到过这样的情况，他并不知道如何处理自己军中的叛乱；在过去，他视这些将领为朋友和伙伴，但现在他们直接公然地抗拒继续前进的命令，他并不知道该做什么。于是，亚历山大妥协了，他同意他的将领们带着自己的人走陆路先行回巴比伦去，而他自己和罗克珊娜以及几个随从会继续前进，直到到达外海的码头，在那里他们会坐船回去。那些将领毫不犹豫地离开了，只有赫费斯提翁和一支小队留了下来，他宣誓继续保护亚历山大夫妇。他们一行人换上了当地人的行头，伪装成迁徙的旅人，继续向东，深入到摩揭陀的疆域。那时，罗克珊娜已有身孕，很难继续前进，他们便打算在她生产以后再继续赶路；战马“牛头”因衰老离世，他们把它葬在里拉詹河畔（Lilajan）的乌鲁维拉（Uruwela），并打算停下休息，看到那里有人正在供奉一棵圣树，他们离近后发现那也是一棵无花果树，便摘了果子交给赫费斯提翁，托付他先一步回到巴比伦，把这棵树的种子交给幼发拉底河入海口处，守护圣树的村民们，把这来自世界尽头的种子种下去，让它们的后代繁衍生息，作为替换未来世界树的继任者。罗克珊娜还嘱托赫费斯提翁，让他告知她的妹妹接替她继承大祭司的职位，并让他提醒她妹妹，把曾教给她的那关于密特拉到来以后要说的话记牢。除此以外，亚历山大还手谕了一封告知信，拖赫费斯提翁交给早在他追击贝苏斯以前就已选择镇守后方，现在正在埃克巴坦那的帕曼纽，告知他自己已经放弃了马其顿的王位，并选好了继承这个庞大帝国的人——那个人的名字被附在了信的结尾处，他希望作为帝国主帅的帕曼纽能够对这个继承者给予支持和拥护。赫费斯提翁挥泪与亚历山大告别，踏上了回程的路。没有人知道当时亚历山大在信上写的究竟是谁，但当这封信被交至帕曼纽处不久，帕曼纽与他的儿子菲罗塔斯就被人双双刺死。没有人知道谁是这背后的主谋，因为刺客黑色克利图斯不久也暴毙而亡。紧接着，对信内容唯一知情的赫费斯提翁也突然病逝。在那之后不久，从巴比伦就传来了亚历山大死亡的消息，然后是失去保护的波斯太后西绪甘碧丝被伪装成了自杀，死在皇宫之中，她的孙女帕瑞萨娣丝则在那之后失踪，再也没有人见过她。远在马其顿的安提帕特和奥林匹亚丝得到的消息是亚历山大在巴比伦因病逝，但他的尸首已经在将军们的抢夺中没了踪迹。很快，帝国开始分崩离析，陷入到无尽的争斗与战乱之中。亚历山大与罗克珊娜并不知道这些事情，他们在孩子出生后，继续向东，到达了恒河窦（Sinus Gangeticus）海的海岸。但当地的人却告诉他们，他们完全走错了方向，如果继续向东行进，就会发现在印度的东面，还是一片没有尽头的大陆。到此时，两个人才彻底放弃了这个不实的梦想，并决定回到那个曾让他们流连徜徉的宁静田野去，在那里买一块土地，盖一座房子，男人砍柴，女人织布，过最悠然恬淡的普通人的生活。当他们回到巴克特利亚的村庄，就给自己取了新的化名。男人叫乌拉赫斯，女人叫伊南娜，而他们的孩子就是伊奥斯·卡夫索。
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