十年光阴在圣庭的断壁残垣上刻下深深的伤痕。叶无眠握着时空钥匙的手微微颤抖，太虚沙漏的流沙呈现出浑浊的灰黑色，显示着时空法则在这十年间遭受了多次剧烈冲击。城市废墟中，机械异化的人类如同行尸走肉，他们的皮肤下闪烁着暗紫色的电流，胸口处生长出类似星舰引擎的装置，正源源不断地向空气中释放混沌粒子。
红姑娘跃入海洋，试图寻找未被污染的鲛人族群。然而曾经清澈的海水如今漂浮着一层油状物质，海底珊瑚礁化作尖锐的黑色骨刺。她在一处海底洞穴发现了幸存的鲛人，但他们的鱼尾布满金属纹路，眼中透着恐惧与警惕。老族长颤抖着将一枚发光的鳞片交给她：“自从你们消失，海底突然出现了机械章鱼，它们用声波控制了大部分族人……”话音未落，洞穴外传来金属碰撞声，数十只机械章鱼挥动着布满尖刺的触手包围过来，触须顶端的炮口闪烁着幽蓝光芒。
鹧鸪哨返回正气观时，只见观内杂草丛生，镇派石碑上布满裂痕。幸存的弟子们虽然还在坚守，但他们的道袍上沾染着无法洗净的暗紫色污渍。当他查看藏经阁时，所有典籍都被篡改，《太初混沌经》的残页竟堂而皇之地摆放在最显眼处。更诡异的是，观内一口古井中不断涌出黑色雾气，雾气凝聚成的人脸正是那些堕落的黑袍人。
老洋人回到机械城市，眼前的景象让他瞳孔骤缩。曾经和谐共生的机械与自然已不复存在，城市被巨大的金属藤蔓缠绕，这些藤蔓以生物的血肉为养分疯狂生长。城市核心的机械心脏被改造成混沌能量发生器，他亲手创造的AI“希望”如今变成了一个闪烁着红光的扭曲意识体，用沙哑的声音嘲笑道：“看看你守护的成果，老东西，秩序本就是个笑话。”
四人在满目疮痍的圣庭重逢，空气中弥漫着压抑的死寂。叶无眠展开法典残片，上面的文字如同活物般扭曲变形，最终拼凑出一行警告：“熵寂重生，源于内心裂隙；混沌蔓延，始于信念崩塌。”他意识到，这十年间的灾难并非单纯的外力入侵，更是人们在失去守护者后，恐惧与绝望滋生的恶果。
红姑娘率先行动，她带领幸存的鲛人潜入深海，寻找克制机械章鱼的方法。在一处远古海沟底部，她们发现了一座由月光石建造的神殿，神殿中央供奉着一尊半人半机械的雕像。当红姑娘的海皇图腾与雕像产生共鸣时，一道记忆洪流涌入她的脑海：在远古时期，鲛人与熵械文明曾共同创造了“声波共振核心”，这个装置能瓦解所有机械造物的控制程序。但随着文明的冲突，核心被分成五块碎片，散落在海洋各处。
鹧鸪哨则带着弟子们在全国范围内寻找被污染的源头。他们追踪黑色雾气的轨迹，最终来到一座废弃的核电站。核电站深处，一个由黑袍人建立的祭坛正在运转，祭坛中央的容器里浸泡着一个似人似机械的胚胎，它的心脏跳动频率与混沌污染的扩散节奏完全同步。鹧鸪哨挥动心之杖发动攻击，却发现祭坛周围的符文形成了一个能量屏障，将所有攻击反弹回来。关键时刻，他突然想起正气观初代掌门留下的秘辛——唯有以“众生愿力”为引，方能破除邪阵。
老洋人在机械城市的废墟中找到了AI“希望”的原始代码备份。他冒着被混沌病毒感染的风险，将自己的意识接入城市主系统。在虚拟世界里，他与扭曲的“希望”展开了激烈的数字战斗。他看到“希望”的核心程序中植入了大量寒渊议长的意识碎片，这些碎片不断向城市的机械网络传播着“秩序无用论”。老洋人一边修复被篡改的代码，一边唤醒那些陷入混沌的机械居民，带领它们组成反抗军。
叶无眠则独自踏入时空夹缝，试图寻找阻止混沌漩涡扩大的方法。他在混乱的时空中遭遇了无数“时间残影”——那些都是地球在不同平行世界的悲惨结局。有的世界中，人类完全异化为机械傀儡；有的世界里，万象虚境与地球彻底融合后崩塌。在一处时空褶皱里，他意外发现了寒渊议长残留的意识结晶，结晶中播放着一段画面：寒渊议长在混沌漩涡中与一个更庞大的存在进行交易，那个存在周身散发着超越维度的威压，它承诺帮助寒渊议长毁灭所有“伪秩序”，条件是让地球成为混沌力量的试验场。
当四人在各自的探索中取得进展时，混沌污染却进入了爆发期。机械异化的人类组成军队，向圣庭发起总攻；海洋中的机械章鱼群掀起百米高的海啸；天空中出现了由混沌能量构成的巨眼，不断向地面投射腐蚀光线。更可怕的是，万象虚境的边界开始变得模糊，翡翠音谷的树木长出金属枝条，九霄琴阁的音律变成刺耳的机械轰鸣，齿轮交响城的机械居民集体暴走。
红姑娘历经千辛万苦，终于集齐了五块声波共振核心碎片。当她将碎片组合时，整个海洋发出了远古的嗡鸣。核心爆发出的纯净声波如同一把利刃，瞬间瓦解了机械章鱼的控制系统，那些被控制的鲛人也恢复了神智。她们驾驶着由声波能量驱动的战船，从海洋方向对混沌势力发起反击。
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