随着时间的流逝，两人一路成为了仅次于大首领的冥使，玄玉也成为了两人手底下的人使。
但是魂却与左殇出现了观点上的分歧，左殇认为组织作为真正有实力的人，应当尽快一统江湖，将力量整合起来，这样才能真正做出一番事业；魂却更加支持老首领的做法，即给武林制定基础的规则和底线，但是不多做管理。
作为左殇上位的唯一竞争者，他给魂设下了一个局。
雨夜，玄玉外出任务迟迟未归，魂原本打算找左殇去寻找玄玉，但是左殇又恰好和师傅一同出门了，魂只好自行前往，但他却在大漠中发现了玄玉的尸体。
一怒之下，他无暇思考为什么凶手就坐在一旁，只当他是在运功疗伤。趁他病要他命，一剑斩过，却发现坐着的人是他与左殇的义父，也是组织的首领：沐天邈。
此时，左殇出现，告诉了魂真相。玄玉早就与左殇暗合，谋划上位之事多日，但老首领一日不死，他一日不得上位，便一日不能实现自己的抱负。
因此他需要一个人杀死老首领，但那个人不能是他，也不能是玄玉。
现在，魂作为组织的叛徒，本应被组织追杀，从此亡命天涯。
但是左殇念及旧情，也希望可以抛去一切的计谋和顾虑，与魂平等的一决生死，由胜者来谱写接下来的篇章。
至此，便接上了游戏的开头。
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