两队90分钟打平，加时赛再战。英格兰队的瓦德尔利用对手失误抢得皮球，直接攻入禁区，轻轻松松获得单刀机会，大力抽射球门远角，德国门神伊尔格纳毫无反应。这记必进之球居然鬼使神差击中远端立柱，到了下半时，德国队中后卫布赫瓦尔德一脚30米左右的远射直飞死角，英格兰门将希尔顿飞尽身形扑了出去，皮球最后击中了门框。
加时赛双方都没有再进球，双方点球决胜。英格兰队皮尔斯和瓦德尔接连射失，最终西德队4比3点球取胜。
本届世界杯上，英格兰的加斯科因大放异彩。他成为了英格兰真正的中场大师，有无限的想象力和灵感，掌控着英格兰进攻的方向和节奏。他是如此的灵巧，比巴恩斯的脚下技术更出色；他又是如此的积极，比比尔兹利更有活力；他的调动和传递比瓦德尔更有全面的大局意识；他的冲击力比罗布森更有锐气，但他最后还是倒下在西德队的钢铁之墙下。
加斯科因说：“我们是更有优势的一方，不过可惜我们没有赢。加时赛上半场我在中圈和贝特霍尔德争夺，他被我撞倒了。他倒下那一刻我就知道麻烦来了，裁判亮出了黄牌。”
加斯科因说：“那一刻我几乎崩溃，这张黄牌意味着我将缺席下一场比赛，那可能是决赛啊！我看着在地上那个装死的德国人，恨不得给他一巴掌，或者踢他一脚。但比赛没有结束，我只好甩甩头走开了。”
两队点球决胜时，加斯科因没有主罚点球。他说：“教练赛前有安排我踢点球，但我心情太激动了，我知道自己不适合罚点球。普拉特挺身而出帮我踢进去了，我很感谢他。但我们还是被淘汰了......太可惜了，我非常伤心。”
比赛结束，加斯科因哭得就像个孩子一样无助。他两眼通红，神情哀伤又迷茫，让球迷们心碎。这个画面成为了本届世界杯最经典的时刻，打动了所有球迷的心。
即使到了季军争夺战，英格兰和意大利也打得火花四溅，非常精彩。尽管没有加斯科因，但英格兰队还是踢得非常出色。而意大利队则把上一场被淘汰的压抑全发泄在了这一场，巴乔全场表现非常耀眼，他上半场就单刀直入，利用英国门将失误门前6码破门，后面还错失了两次机会。英格兰落后之下也大举进攻，普拉特头球扳平。踢到比赛最后意大利得到一个点球，将比分锁定为2比1。
决赛在1990年7月8日的罗马奥林匹克体育场进行，对阵双方是联邦德国队和阿根廷队——上届世界杯决赛再次重演。阿根廷队四名主力因累计黄牌两张而无法上场，马拉多纳一个人与西德队对抗。
决赛开始之后，很多球迷都以为西德队会主动出击，趁对手缺兵少将而加强攻势，但西德队却显得极为功利。在阿根廷的灵魂马拉多纳带伤上阵、卡尼吉亚被停赛的情况下，西德队还是以防守为主，布重兵于本方禁区之前，一心与对手拼消耗。阿根廷队因为多名大将缺阵，明显落在下风。马拉多纳在整场比赛里都被西德球员贴身跟防，贝肯鲍尔为他专门制定了极为粗野的“砍马战术”。在马拉多纳被围困之后，阿根廷队很难组织起有效的进攻，没有办法发挥快速突击的优势。比赛场面一度非常沉闷，阿根廷队处于下风，但西德队一直不主动进攻，更不会大举压上。下半场阿根廷队的蒙松和朱斯蒂接连被红牌罚下，球队迅速陷入被动。西德队乘机由沃勒尔带球冲入禁区造点球成功，布雷默主罚破门，帮助西德队锁定胜局。
最后，西德队捧起了世界杯的冠军奖杯。
全场比赛遭遇多次粗野犯规的马拉多纳，赛后极其不满裁判的判罚，他认为这些犯规都应该出示红牌，但竟然连黄牌都没有。马拉多纳在亚军领奖时拒绝与当时的世界足联主席阿维兰热握手，抗议比赛的不公。
这场决赛并不精彩，西德队防守至上，极为功利，更是让世界杯失色。本届世界杯平均进球数刷了历史最低，仅仅为每场2.21个。克鲁伊夫尖锐批评，“参加世界杯的球队都想赢怕输，过于保守，不敢进攻，不能真正展现足球的魅力，实在是太令人遗憾。”的确如此，只有小组赛的比赛大家才放开手脚，踢出多场精彩比赛，到了淘汰赛阶段就变得非常沉闷。多场比赛最终只能通过互罚点球决出胜负。而在决赛中西德队全力以赴摆大巴，更是令球迷超级不爽。
莱因克尔后来说，“足球就是22个人踢球，到了90分钟结束时候由德国人获胜的比赛。”这个说法引发了相当多的共鸣，因为德国人踢的足球实在是太无趣了。
弗格森全程观摩了世界杯的比赛，他觉得有非常多的战术精华需要学习。弗格森研究了德国和意大利队的防守安排，从站位到协同，从战术执行到场上纪律，对各种细节都进行分析。他更是认真观摩了英格兰队的全部比赛，深入研究三狮军团里各个球员的表现。
对红魔队而言，世界杯的后遗症非常严重。队长罗布森只打了一场小组赛就受伤，到了赛季开始时都没有彻底伤愈。而帕克和韦伯也因为参加世界杯而出现体能问题。可以说，红魔队的实力因为世界杯而受到了严重的削弱。
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