郭靖对武穆遗书中的很多兵法都不甚理解，鲁有脚主动为郭靖一一解释，也因此郭靖迅速成长，成功夺得一战胜利。郭靖再次请教鲁有脚兵书问题，鲁有脚还是推辞到明日再解说，郭靖起疑跟随鲁有脚，却意外在树林碰到来此寻找黄蓉的欧阳锋。欧阳锋想要拿下郭靖逼迫黄蓉现身，两人对阵引来丐帮众人，而欧阳锋也不慎被郭靖打伤，为了不引人注意，他只能暂时离开。
铁木真因为攻打撒马尔汉城失败而动怒，如今进退两难，鲁有脚提出建议，郭靖从其中也猜出这是黄蓉出的主意，让鲁有脚带自己去见黄蓉。鲁有脚眼见瞒不住郭靖，只得带他前去见黄蓉。鲁有脚告诉郭靖帮主就在秃木峰山顶，郭靖为了见黄蓉不惧被摔死的风险，一次次试图攀峰。鲁有脚不忍郭靖受伤，给他出主意让他利用羊腿搭建攀岩梯子顺势爬上山顶。郭靖与黄蓉再次相见，两人相拥一解思念之情。郭靖因为自己此前误会黄药师和黄蓉而道歉，也坦诚对黄蓉是真心相对。郭靖询问黄蓉如何逃出来，黄蓉解释她故意带着欧阳锋前往归云庄，利用归云庄的八卦阵困住欧阳锋，趁机逃走。后来黄蓉想重回桃花岛，但是欧阳锋一路追拦，她只能一路向北来草原寻郭靖。她潜入军营，而欧阳锋为了找她也潜入蒙古族军营，为了不给郭靖添麻烦，黄蓉才一直没有寻郭靖。
郭靖让黄蓉日后就陪在自己身边，再也不要离开自己。黄蓉察觉欧阳锋也来附近，故意和郭靖提起九阴真经，她表示自己会译好的九阴真经默写出来，而为了防范欧阳锋她们也不能将九阴真经带离山顶之外。欧阳锋听到两人对话，决定在山顶等着两人。郭靖和黄蓉从山顶下来后，就顺便将羊腿搭建的梯子烧毁，势必要将欧阳锋困死在山顶。欧阳锋在山顶等到半夜也没发现郭靖和黄蓉，他大骂两人不讲诚信。
大军围城数日久攻不下，蒙古兵已经面临断粮，郭靖也因此心情不佳。随后黄蓉看到欧阳锋竟然从山顶飞跃而下，她由此想到攻城的办法，让郭靖命令将士将帐篷割破制成双翼，以此来制作革伞助大军攻城。在革伞的相助下，郭靖和黄蓉带来将士飞入撒马尔汉城，成功打开城门助铁木真带着铁骑闯入，而完颜洪烈得知消息后再调兵已晚，郭靖入城后本想追着完颜洪烈的残兵而去抓拿完颜洪烈，在黄蓉的提醒下想到完颜洪烈或许不在残兵之内。他在城中被俘的将士中搜寻一番，果然找到藏身于此的完颜洪烈。
郭靖将完颜洪烈带到铁木真面前，落到如此地步完颜洪烈自然无话可说。铁木真将完颜洪烈交给郭靖处置，完颜洪烈面对郭靖的质问，坦然承认当年杀害郭杨两家的事实，郭靖让完颜洪烈为这段恩怨做个了解，完颜洪烈认为自己落得如此境地是为大金而死，但是郭靖一个宋人却为铁木真卖命，更直指铁木真灭了大金后，就会屠戮大宋，完颜洪烈告诫完郭靖后自刎而死。
郭靖立此大功，铁木真要奖赏他，郭靖看到铁木真要将城里城外的俘虏尽数斩杀，不忍之下以奖赏换取这些百姓和俘虏的性命，铁木真虽大怒却同意了郭靖的请求。郭靖回大帐发现华筝在此，黄蓉本以为郭靖已经退婚，但未料到郭靖坦诚自己没能退婚，他用攻城的功劳换取了无辜百姓的性命。黄蓉希望郭靖放弃自己负气离开，郭靖只能辞别华筝迅速追寻黄蓉。途中郭靖发现陷入流沙中的欧阳锋，欧阳锋以黄蓉行踪骗郭靖将自己救出流沙，随后编造黄蓉已经陷入流沙而死的谎言，郭靖误以为黄蓉已死悲痛吐血。一个月后，铁木真想要继续攻下金人所在之都大梁，郭靖提出佯攻大梁，待潼关援兵至后打破金兵，如此大梁自然不攻自下。郭靖本想南下带着母亲回家乡看看，却被铁木真以战场危险一口否决。
李萍得知此事后认为铁木真如此行事必定另有他情，得知铁木真给了郭靖和托雷等人锦囊，让他们攻下大梁后再打开依计行事。李萍暗中拆开锦囊发现铁木真让郭靖等人攻下大梁后移师南下攻打临安，灭了大宋。李萍知道这是铁木真要以自己性命要挟郭靖，郭靖不愿通敌求荣，决定当晚带着母亲回临安。
郭靖当晚要离开之际被铁木真发现，郭靖认为铁木真和大宋联盟攻打金人，却中途毁约算不得英雄，铁木真并不认为自己毁约，他要将郭靖以拆开锦囊违抗军令而下令军法处置。华筝和托雷纷纷为郭靖求情，铁木真让郭靖发誓效忠蒙古族，但是郭靖却坚持本心不愿灭宋。铁木真命人带来李萍威胁郭靖，李萍提起当年丘处机为郭靖和杨康取名初衷就是希望他们能不忘靖康之耻。李萍不愿儿子成为背节之人，让儿子做想做之事，成为想成为的人，随后李萍以匕首自杀，死在郭靖怀中。郭靖将母亲葬在绿洲，托雷和华筝寻来此处，两人知道留不住郭靖，特意前来告别。华筝偷偷将郭靖要走的消息告诉铁木真也只是想留住郭靖，却不想却因此害死郭靖母亲，华筝自责要以死谢罪，郭靖拦住华筝，他并未怪罪华筝，也谢谢两人来送自己。
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