当初，王允以同郡宋翼为左冯翊，王宏为右扶风。李傕打算杀害王允，又担心两郡起兵反抗自己，于是征宋翼、王宏入朝。王宏劝说宋翼起兵，宋翼不从，王宏也只得一同受征，两人到达长安后，李傕就把他们收捕，带到廷尉处问罪。六月七日甲子，李傕将黄琬、王允、宋翼等人全部处死，百姓闻之莫不流涕。
李傕等人将董卓埋葬在郿县，并把董氏族人的骨灰聚起来放到一个棺材里。传说在下葬之日，出现狂风骤雨，冢墓被雷电劈开，水土流进墓里，棺材也被积水漂起来。李傕重新埋葬，之后又爆发风雨，水溢进棺椁里，这样的事反复出现了三四次，冢中堆积了一半的雨水。樊稠等人共同把棺材埋下，而风雨越来越猛烈，埋葬后，大风再次刮破冢墓。
此时，汉少帝（弘农王）刘辩的妃子唐姬自从少帝被李儒毒杀后就回到娘家颍川居住，李傕攻破长安后派兵掳掠关东地区，掳获唐姬，李傕欲娶唐姬为妻，唐姬坚决不答应，也始终没说出她是少帝妻子的事，后来尚书贾诩知道了此事，告诉了汉献帝，献帝十分伤感，下诏接回唐姬，让她住在少帝的园中，派侍中持节封唐姬为弘农王妃，自此，唐姬终生未嫁，八月，诏太傅马日磾、太仆赵岐杖节镇抚关东。
初平三年（192年）九月，又进封李傕为车骑将军、开府、领司隶校尉、假节、池阳侯，郭汜为后将军、美阳侯，樊稠为右将军、万年侯。张济被封为镇东将军，外出屯驻在弘农。以贾诩为左冯翊。
当初，董卓入长安时，邀请凉州军阀韩遂、马腾共谋关东诸将，韩遂、马腾见天下大乱，也打算依靠董卓起兵。这一年，韩遂、马腾率众来到长安投降，李傕拜韩遂为镇西将军，让他返回金城；马腾为征西将军，屯在郿县。
冬十月，李傕举博士李儒为侍中，献帝下诏：“李儒之前为弘农王郎中令，迫杀我的兄长，应当加罪。”对方推辞：“董卓所为，非李儒本意，不可惩罚无辜之人。”
初平四年（193年）七月，献帝想发太府丝织给宫人制作衣服，李傕不愿，说：“宫中有衣服，何必要再做？”
尚书郎吴硕素来奉承李傕，便附和道：“关东还没平定，国家费用不足，陛下宠爱之人穿的衣服，已经远凌驾于群僚了。”尚书梁绍上书请治吴硕之罪，献帝以吴硕受李傕宠爱而不许。
兴平元年（194年）三月，马腾、韩遂联合侍中马宇、故凉州刺史种邵、左中郎将刘范、中郎将杜禀共攻李傕，李傕令侄子李利和郭汜、樊稠出战，与马腾、韩遂大战于长平观下。樊稠、郭汜大胜，斩首一万多人，种邵、刘范当场战死，马腾、韩遂退回凉州。
不久后，李傕赦免马腾，又拜马腾为安狄将军，韩遂为安降将军。
樊稠在追击韩遂、马腾时，与韩遂并马拉着手臂，说笑了很久，李利将此事告知李傕，李傕自此开始怀疑樊稠。郭汜、樊稠因功加“开府”之权，权力大增，跟三公、李傕合为六府，李傕等人各选用自己所举之人，稍有违反就会生气。主者深以为患，于是按顺序选用他们所举之人，先从李傕起，郭汜次之，樊稠次之。而三公所举，终不见用。朝廷在关中内部的权力大减。此时是李、郭、樊三人权力最大的时刻。
这一年全国大荒，献帝下诏让主者将一百多匹厩马（一说两百多匹）全部卖掉，又令御府大司农出两万匹杂缯，与卖马得来的钱一同赐给公卿、贫民，李傕说：“我邸阁里的物资少。”于是强行把这些东西带到自己营中。贾诩劝道：“这是圣上之意，不可违背。”李傕依然不从。
当时谷一斛五十万，豆麦二十万。长安城内盗贼横行，白日抢劫，李傕、郭汜、樊稠把城中分成三份，各守其地，但还是不能控制。而李傕等人放纵子弟侵害三辅百姓，造成更严重的饥荒，人民相食，白骨堆积，污秽满路。这场灾难被《魏略》称作“三辅乱”，当时关中百万以上的人口，各自饿死逃窜，纷纷南迁至刘表、刘焉、张鲁等人的领地。
兴平二年（195年），李傕等人相互争权夺利，矛盾越来越激化。二月，樊稠欲带兵向东出关，向李傕索要更多的士兵，李傕顾忌樊稠勇而得人心，又因为当初樊稠私自放走了韩遂，于是让樊稠、李蒙过来参加会议，使外甥骑都尉胡封在会议上刺死了樊稠、李蒙，兼并了樊稠、李蒙的部队，诸将更加相互猜忌。
李傕经常在自己家设酒宴请郭汜，有时留郭汜在自己家住宿。郭汜的妻子害怕李傕送婢妾给郭汜（一说害怕郭汜与李傕的婢妾私通）而夺己之爱，就想挑拨他们的关系。一次李傕送酒菜给郭汜，郭汜妻子把菜中的豆豉说成是毒药，郭汜食用前郭妻把豆豉挑出来给郭汜看，并说了李傕很多坏话，使郭汜起了疑心。过几天李傕再宴请郭汜，把郭汜灌得大醉，郭汜怀疑李傕想毒害他，赶紧喝粪汁催吐解酒。于是率兵相攻，交战连月，死者万计。李傕请贾诩为宣义将军，来帮助自己。汉献帝派侍中、尚书劝解，没有成功。安西将军杨定害怕李傕谋害自己，就与郭汜合谋劫持汉献帝到自己的营中，夜间，有人逃走，把他们劫持天子的计划告诉李傕。
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