创世神树死后，蓝星陷入一片混沌，奥米加兽、杰斯兽和邹旭利用时钟兽的卡片力量，成功地重塑了这个次元时空的秩序，使得时间与空间重回正轨。
随着蓝星秩序的恢复，蓝星之灵也奇迹般地重生，它始终与蓝星紧密相连。
诺恩也发挥世界树的强大权限之力，让蓝星之灵完成进化。
蓝星之灵进化，蓝星也跟着进化，蓝星上除去人类以外，其他精灵都变的宛若起源世界的精灵一般强大。
因为需要人类的信仰和联系，蓝星之灵也代替了恶魔果树的责任，剥离自己的一小部分力量，化作大片的果树和果实和人类签订契约。
一切看似井然有序时，人们也没有意识到，有一个关键人物不见了踪影。
邹旭早已让蓝星之灵抹去他在这个世界留下的痕迹，然后默默离开了这个时空。
坦白来说，自始至终邹旭都未曾对这个世界倾注过过多情感。
无论是过去还是现在，他都清楚地知道，这里并非属于他的世界，所以他从未将感情倾注于这个世界的任何一角。
他很感谢你在这个世界让他能够遇见亚古兽他们，但这始终不是他的归宿，他和亚古兽它们向往的从不是安逸的生活，所以在这个世界，他也只不过是借助此地稍作停留，调整状态，然后继续前行罢了。
如今这个时空的故事结束，也是时候该离开了。
“大哥，我们要去哪啊？”数码空间裂缝中，邹旭站在奥米加兽的肩膀上问道。
“去一趟太一那个时空吧，上次的事情还没有彻底结束呢！”
“太一吗，就是大哥经常说的那个很厉害的数码宝贝和驯兽师吗？”奥米加兽表示相当有兴趣。
听说对方的数码宝贝搭档也是亚古兽，它已经迫不及待的想要较量一下了。
“是他，不知道我离开的这几天数码世界有没有什么变化！”就在邹旭思量的时候，一道尖锐的哨声直接打破了他的思考。
伴随着一道奇妙的数码旋律和撕心裂肺的呐喊。
“向着未来……前进！”
“这是？”这熟悉的画面，让邹旭的思绪不禁加快，对奥米加兽催促了一声道：“亚古兽，快，跟着这股波动！”
而此刻在数码世界，东京御台场……
世界陷入一片漆黑混沌，一道道虚幻的数据不断涌向高空，美轮美奂的梦幻岛出现在众人眼前。
一道宛若世纪女神般的虚影屹立苍天之上，宛若神明般俯视下方大片的军队。
“是超究极体的厄俄斯兽！”
“就是他世界上所有被选召的孩子陷入沉睡的，只要打败他，所有数码兽和被选召的孩子都能苏醒！”梅诺亚的身边潜伏的助手井村对首领说的。
“戒备！”不知火玄点了点头，他不是被选召的孩子，只是和领主骑士兽搭档，所以并没有被吸引入梦幻岛被控制。
同样是的还有他身边几位未被控制的都是数码世界选择的在人类世界的搭档。
龙国南宫无双的释迦兽，目前世界上已知搭档数码兽最强的存在，超究极体数码兽，被誉为最接近世界树的存在。
R国的不知火玄和四宫院绫，搭档是前面提到的皇家骑士中的领主骑士兽和芳香兽。
领主骑士兽
芳香兽
M国伯特的搭档西方十二神族之一的朱庇特兽。
E国埃尔夫的四大龙之一的肌肉龙神龙兽。
Y国尼德霍格兽，F国的阿喀琉斯兽这些究极体和超究极体的集合，按他们这个阵容的，按理来说，只要不是世界树，金刚武神兽，杰斯兽GX这些挂壁应该都能解决。
尼德霍格兽
阿喀琉斯兽
但他们面对的却是另一个比较麻烦的存在。
厄俄斯兽！
利用自己的力量创造搭档和数码兽永不分离的世界，直接控制了全球所有的被选召的孩子。
如果只是厄俄斯兽和那些普通被选召孩子的话，问题还不是很大，但主要还包含太一这些，带着徽章的孩子，战力无法估测，就很麻烦。
一个黑化的奥米加兽，一个帝皇龙甲兽：圣骑士型，两大天使长的神圣天女兽和究极天使兽，余下还有几个唯心的究极体，加上厄俄斯兽这个超究极体。
麻烦的很，他们还不能轻举妄动，以免真的激怒到了对方。
事情的开始，还要从邹旭离开之后开始说，几个被选召的孩子在望月教授的指挥下重新返回这个世界。
并且因为世界树的再启，数码世界在恒常性的制衡下趋于稳定，不会强势入侵太一等人所在现实世界，但还是有许多数码兽在几位数码兽搭档的领导下，利用神圣计划和再次和人类进行联系。
一时之间，全球被选召的孩子数量大幅上升。
而因为掌管太一高中时空的时钟兽被邹旭消灭了，导致这个时间段时空混乱，世界树为了保证后续时空连接性的稳定，就加快了时空的时间流速，使一些过度的事情过的很快，直到太一等人已经上了大学，时间才重新恢复正常。
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