开启万花筒写轮眼后，看清楚了南贺神社石碑上的秘密，并与面具男达成协议。
那时的宇智波一族已经因为宇智波止水的死亡，对村子里产生了极大的不信任。
矛盾已经激化到了顶点，权衡利弊的他为了和平，最终选择了木叶。
之后又为了保护他这个弟弟，与三代火影达成协议，成为间谍，潜入小组织。
“哥哥…”
宇智波佐助，双眼一阵刺痛，随后大量的查克拉涌入身体，接着只觉得眼前一阵眩晕。他的双眼竟然变成了万花筒。
就在这时，宇智波鼬的另一只眼睛，出现了宇智波鼬的幻影。他样子依然如以前那般温柔，只不过面容极其憔悴。
“佐助，当你看到这条幻境留言的时候，我已经不在了，不过我还是希望你能够继承我的意志，去实现真正的和平。
忍界太残酷了，只有强大的木叶才能镇守一切。晓组织不是长留的地方，这里有太多的黑暗和阴谋，记住不要相信任何人，我们只是为了利用你的力量达成某种目的。最后再跟你说一声再见！”
幻影消失了，宇智波佐助早已泣不成声，这一刻他仿佛回到了小的时候。
“火之意志真是一个可怕的东西。”
“对不起，我不会听你的话回去。我对你的想法一直不认同。至于你自己的愿望，那就由你自己来亲自达成吧。”
宇智波佐助决定找到宇智波鼬的尸骨将他复活。所以他不打算吸收掉宇智波鼬的万花筒写轮眼。
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