后来荆州刺史徐璆、南阳太守秦颉与朱儁会合，汉军此时只有一万八千余人，但是却包围了有十几万人之众的宛城。
朱儁连续一个月都在不断的打造攻城器械，结果遭到了宦官势力的弹劾，朱儁不得不发动军士进行猛攻，并在一次战斗中击毙了黄巾统帅赵弘。
赵弘虽死，黄巾军的主力并没有折损，黄巾军又推举韩忠为帅，仍旧占据着宛城。朱儁只得再攻宛城，以便能尽快以胜状回禀朝廷。通过观察，朱儁发现黄巾新帅对部队的调动并不熟练，同时也欠缺临敌制变的机巧。于是朱儁策划了一次佯攻。他让士兵们敲着战鼓，虚张声势进攻宛城的西南角，黄巾军果然全都被吸引到宛城西南防守。朱儁却亲自率领孙坚等精兵偷偷攻打宛城的东北角。朱儁身先士卒，登上城头，率先突入韩忠摆设的防御工事，打开东北部的城门。汉军鱼贯而入，宛城的防御顿时被撕开一道口子。韩忠知道破绽已经难以封堵，于是只得退守小城，并惊慌失措地向朱儁请降。
不过朱儁果断地拒绝了黄巾军的投降，奋力攻打宛城西南的小城，结果可想而知。十万人被迫死战，朱儁怎么可能成功？
他命令军士筑起土山，日夜观察黄巾军的动向。经过多日的思考，他终于发现和黄巾军搏命不是一个好的选择。于是他和司马张超骑都尉曹操等人商议，将包围圈撤除一角，引敌人突围，然后再寻求野战。朱儁的计策果然成功。汉军在西面的包围假装出现了漏洞，韩忠直接撇下大军，只率领本部出城逃跑，朱儁在后掩杀，大破黄巾军，司马孙坚追斩韩忠，最终杀敌万余。
眼看是计的黄巾余众不再考虑突围，而是又推举孙夏为帅，从小城出兵，再次攻占了宛城。兵力捉襟见肘的朱儁无力兼顾，只得再次计划攻打宛城。
朱儁的政治压力越来越大，他每天都能梦见宦官一系有司官员口沫横飞地数落他的不是。于是他命佐军司马孙坚为先登猛士，昼夜不停地攻打宛城，终于打破宛城城门，逼迫孙夏北逃。
朱儁率兵追击孙夏到西鄂县的精山，于山脚下击溃黄巾军，夏侯惇斩杀孙夏，汉军大败黄巾军，黄巾军阵亡超过两万人，重伤者更是不计其数。而残余的黄巾军再也没能推选出新的统帅，最终被汉军击败，荆州就此安定下来。
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