酶联免疫吸附试验、血凝抑制试验、中和试验和间接荧光抗体技术是本病常用的实验室诊断方法。
由于本病毒抗体在发病的初期效价较低，且隐性感染或免疫接种过的人和动物血清中都可出现抗体，因此均以双份血清抗体效价升高4倍以上作为诊断标准。血清学方法多用于回顾性诊断或流行病学调查。
机体感染本病毒后3～4d即可产生特异性IgM抗体，2周达到高峰，因此测定血清中的IgM抗体可做出早期诊断。
比较同一被检血清在2-ME处理前后的血凝抑制效价，如效价相差4倍以上，即可证明血清中的血凝抑制抗体为IgM。此法的早期诊断率可达80%以上。
4.鉴别诊断
当猪发病时，应注意与布鲁菌病、猪繁殖与呼吸综合征、猪伪狂犬病、猪细小病毒病等相区别。
【防控】
预防流行性乙型脑炎，应从控制传播媒介和易感动物免疫接种这两个方面采取措施。
1.控制传播媒介
以灭蚊、防蚊为主，尤其是三带喙库蚊。
应根据其生活规律和自然条件，采取有效措施。对猪舍、马册、羊圈等饲养家备的地方，应定期进行喷药灭蚊。对重要易感动物(如种公猪)圈舍必要时应加防蚊设备。
2.免疫接种
易感动物可接种乙脑疫苗。
目前国际上主要使用的乙脑疫苗有两类，即灭活疫苗和减毒活疫苗，目前多用Vero细胞培养病毒制备。我国研制的流行性乙型脑炎减毒活疫苗种毒为JEV SA14-14-2株，安全性和免疫原性好，可用于人、马、猪，对猪的保护率可达90%。
疫苗使用应注意：
一是易感动物一定要在当地蚊蝇出现季节的前1～2个月接种疫苗。
二是为防止母源抗体的干扰，后备种猪一般在5月龄以上接种。
一般间隔1个月注射两次免疫效果更佳。母猪一般在配种之前接种乙脑疫苗。应重点管理好没有经过夏、秋季节的幼龄动物和从非疫区引进的动物。
本病无特效疗法，应积极采取对症疗法和支持疗法。病马在早期采取降低颅内压、调整大脑机能、解毒为主的综合性治疗措施，同时加强护理，可收到一定的疗效。
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