主剧情：
降临：
1966年7月17日，科学特别搜查队的早田进队员在龙森湖上空驾驶飞机巡逻时，发现从宇宙而来的一个红色球体正在追逐一个蓝色球体。
早田在观察两个球体时，不慎与红色球体相撞而机毁人亡。之后早田的身躯被红色球体吸收，在球体里面，一位神秘的宇宙人将自己的生命给予了早田，使他复活了过来。
复活后的早田和宇宙人生命合一，拥有了变身成为银色巨人的力量。他在用这份力量击败宇宙怪兽百慕拉后，为这位给予自己生命的宇宙人起名为「奥特曼」。
之后，奥特曼与早田一起为了保卫地球，而与众多凶暴的怪兽和邪恶的宇宙人展开了激烈的战斗。
离别：
1967年4月9日，变身怪人杰顿星人率领大波的飞碟入侵地球。为了破坏科学特搜队基地，杰顿星人带来了最终怪兽兵器——杰顿。
早田变身为奥特曼与杰顿战斗，但奥特曼的招式全被杰顿破解，就连必杀技——斯派修姆光线也被杰顿吸收。最终，在象征着奥特曼生命的彩色计时器被杰顿用波状光线击碎后，奥特曼倒下了。
在奥特曼战败后，科特队用新式武器消灭了杰顿。而奥特曼的族人——佐菲赶来地球救援，他分别赋予了早田和奥特曼新的生命，奥特曼在复活的同时，也与早田成功分离。
最后奥特曼与佐菲一起返回了自己的故乡，而早田也失去了被奥特曼附身这段期间的记忆。
重逢：
2006年，奥特曼离开地球已经四十年了。
在这期间，奥特曼没有在地球上再次出现过，而科学特搜队则并入了地球防卫军，科特队的队员们都各自走上了新的人生道路。村松敏夫队长则在1996年去世了。
在2006年的夏季，老去的队员们突然都收到了神秘来信，让他们在村松队长的家中相聚。相聚之后，队员们都表达了自己对村松队长的怀念之情，也回忆起了过去的战斗岁月。
在众人完成合影留念准备离开时，早田独自一人在村松队长家中再次遇见了奥特曼。
原来那信是奥特曼在早田无意识中让他代笔所写。奥特曼把β魔棒重新给予了早田，希望早田能够找到有资格继承这力量的年轻人。
光之国——奥特兄弟体系构成的世界观剧情：
1971年12月，奥特曼与赛文合作使用出了奥特之星作战，拯救了被暗杀宇宙人纳克尔星人抓住的杰克奥特曼，随后奥特曼又和赛文一起训练杰克，将手刀断切斩和奥特投掷传授给杰克。1972年3月，得知触角宇宙人百特星人带着杰顿二世去对付杰克，奥特曼通过感应远距离与杰克对话，让其谨慎对付杰顿。
1972年4月，奥特兄弟们帮艾斯·奥特曼寻找人间体，注视艾斯与北斗星司和南夕子进行合体同化；1972年5月，奥特曼等奥特四兄弟齐聚，发送奥特签名，准许艾斯使用奥特断头刀技能。
1972年6月，奥特曼与佐菲、赛文、杰克一起落入了异次元人亚波人的陷阱，被困于高格达行星，奥特曼等兄弟的能量被亚波人制造的艾斯杀手夺走。在赶来救援的艾斯不敌艾斯杀手之时，四兄弟传输剩余的能量给艾斯，让艾斯集合四战士能源使出宇宙五重光杀敌，奥特曼等人也得以脱险。
1972年9月，奥特曼为了拯救被地狱星人希波利特星人变成青铜像的艾斯，四兄弟一起来到地球，但全都落入希波利特的陷阱而被变成青铜像。最后在奥特之父的牺牲下，奥特五兄弟得以获救。
1973年4月，奥特曼等奥特五兄弟集合，协助奥特之母将泰罗的生命与东光太郎融合。9月，为了拯救被莫鲁罗亚的黑雾夺去光明的地球，奥特曼等奥特六兄弟进行奥特合体，通过了奥特之塔的火焰而取得了奥特之钟，帮泰罗使用奥特之钟驱散黑雾[49]。同年11月，奥特曼与泰罗等奥特六兄弟合力打败了帝国星人。
1974年1月，在佐菲被暴君怪兽泰兰特打败之后，奥特曼在天王星上拦截泰兰特。但泰兰特的实力非常强大，奥特曼最终战败，发出的奥特签名也被打散。
1974年12月，在黑暗星人巴巴尔星人的阴谋下，奥特曼等四兄弟与雷欧和假阿斯特拉交战。在打倒雷欧后，奥特之王出现制止了这场战斗并揭露了假阿斯特拉的真面目，随后四位奥特战士一起阻止奥特之星撞向地球。
1986年，奥特曼与赛文、杰克、艾斯一起在月球上决战究极超兽奥特杀手萨乌鲁斯。在把萨乌鲁斯击落至神户港后，奥特曼四人使用「终极十字屏障」将其封印，但由于封印消耗了四位奥特战士过多能量而导致他们失去了变身能力。之后，奥特曼拟态变身为早田进的姿态，在地球上生活了长达20年的时间。
2006年9月，奥特曼再度变身，并与佐菲、赛文、杰克、艾斯、泰罗、梦比优斯合体为梦比优斯无限形态击败了封印而复出的新萨乌鲁斯。
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