此时，红球催化了不良少年们心中的黑暗，将怪兽欧布猛斯王实体化，我梦变身为盖亚迎战怪兽。在盖亚对欧布猛斯王优势时，欧布猛斯王分化出了怪兽巴吉利斯和斯休拉助战，三只怪兽的围攻使盖亚陷入了绝命危机。
危机时刻，星野勉拿到红球，充满希望的呐喊召唤来了迪迦和戴拿两位光之巨人，援助盖亚对战怪兽。最后，在斯休拉被迪迦打倒、巴吉利斯被戴拿击败后，欧布猛斯王失去力量，最终被盖亚至高型消灭。
战斗结束，盖亚变回我梦，向星野勉道出红球的真相。知道了事实的星野勉，不希望红球再造成伤害，于是许愿希望红球永远消失，修复红球的对世界的伤害。红球消失，它所造成的一切事物也都会消失。我梦将图书还给了星野勉，便留下了鼓励的话语后，也返回了原世界。
盖亚孤身奋战消灭了多个敌人，在对战库罗斯沙巴伽时，我梦终是找到了失踪的藤宫。藤宫的自暴自弃，让我梦也不知如何是好。在和西格玛茨依古尔的战斗中，盖亚误中敌计被抓，将被带离地球。关键时刻，藤宫重拾自我，再度获得海洋之光并变身为阿古茹V2型，击败了机器兽，救下了被困的我梦。
盖亚和阿古茹终于达成共识，两位奥特曼联手作战，消灭了宇宙怪兽超戈布和超巴茨斯。但根源的破灭招来体的攻势也逐渐加强，接踵袭来的强敌---破灭魔人布里布罗茨和泽布卜，虽然都被盖亚击败，但地球防卫力量也受到重创。
战斗到了最后阶段，空中基地因为撞击莫奇安的玉石俱焚式作战而毁灭，XIG的据点换到吉欧基地，而我梦与藤宫的身份也被XIG重要成员得知。“根源的破灭招来体”派出大量蝗虫覆盖地球表面，阻挡阳光，影响通讯，但报导坏消息的新闻却未能阻止。
盖亚奥特曼和阿古茹联手对战魔虫的集合体--破灭魔虫恺撒德比西，但是由于敌人数量太多而陷入苦战。在破灭招来体的最终兵器--根源破灭天使佐格出现后，更以压倒性实力击败盖亚和阿古茹，通过新闻播放转播给全世界，并夺去了他们奥特之光的力量，使他们在全世界人类的注视下恢复本体，以此把人类最后的希望一举击溃。
此时，地球怪兽却大举出现对付魔虫，我梦以地球内部的力量恢复了通讯，“炼金之星”亦与XIG合作，利用怪兽的能量转化成光，使我梦与藤宫再次变回奥特曼并且得到强化，阿古茹V2联手至高型盖亚，歼灭了全部的破灭魔虫，并一举打败根源破灭天使佐格，恢复和平。决战之后，两人都没有了光的力量，我梦最后选择回到大学继续从事研究，而藤宫则独自踏上了旅途。
在击败佐格的数年后，不再是盖亚的高山我梦过回了普通人的生活，回大学继续量子研究。由于根源破灭海神伽库佐姆的苏醒，地球生态受影响而出现异常。GUARD陆续收到来自海底的未知文明“里纳尔”的求救讯号，XIG为了调查事态而出动枪鱼队，并找回了高山我梦协助，下潜到太平洋海沟8000米深的海底调查。
伽库佐姆吞噬里纳尔的力量而完全苏醒，大群的破灭飞鱼遮蔽天空，使地球再度陷入黑暗。我梦等人在海底接触了未知生物里纳尔，但被破灭海神的攻击打坏潜艇，陷入危机。为了挽救地球，里纳尔族以自身力量唤醒了地球之光，让我梦能再次成为盖亚奥特曼。
盖亚和先前已经复活的阿古茹一同迎战伽库佐姆。盖亚起初能互角伽库佐姆，但在伽库佐姆强化后便遭到压制，即使和阿古茹联手也不敌破灭海神强化体，命悬一线。危急时刻，里纳尔集合全族的力量，为两位奥特曼补充光之能源。力量增强的盖亚和阿古茹再度迎战，对破灭海神展开压倒性的反攻，最终以组合技“光子方场”消灭了伽库佐姆（强化体），破灭招来体的阴谋再一次被粉碎。
故事发生在类似于超时空大决战的平行世界，奥特曼只是电视上放送过的特摄剧节目。这个世界中的我梦也并不是盖亚，只是作为一个普通人工作生活着。但在邪心王·黑暗影法师的影响下，怪兽陆续出现于这个世界，并大肆破坏城市。
在危急之时，生活在这个世界的我梦与其他奥特战士的人间体们，觉醒了平行世界的记忆，得到了变身为奥特战士的力量。他们为了人类的未来而变身成为八位奥特战士——盖亚、迪迦、戴拿、初代奥特曼、赛文、杰克、艾斯以及梦比优斯，8位奥特战士与敌人展开了激战。最终，盖亚等八位战士击败了究极合体怪兽吉咖奇美拉，并进入闪耀状态净化消灭了黑暗影法师，取得了最终胜利。
数年后，盖亚被超时空魔神艾塔尔加击败，并与其他7位平成系奥特曼一起被封印在时空城·镜之间。后来，在银河与维克特利的宇宙中的UPG队员们的帮助下，盖亚脱离囚禁，和迪迦、戴拿、高斯、奈克赛斯、麦克斯、梦比优斯、赛罗以及银河维克特利奥特曼等奥特十勇士集结，对艾塔尔加展开反攻。
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