就算不从血统的角度出发，就术赤这个智商，铁木真不选他当继承人也是有道理的。
面对这种脑残的要求，玉龙杰赤人民自然没有答应，并将他的使者大卸八块。
于是，战争开始了。
蒙古大军发挥了他们在战争器械方面的优势，而且因为巨石不易运输的缘故，他们就地取材用被水浸泡过的桑木当作炮石向城内疯狂抛射，而且还驱赶着大批的奴隶去填平城外的壕沟，同时还去截断城中的水源，企图用断水的方式逼迫城内的守军投降。
但他们的进攻遭到了守军的顽强抵抗，仅仅几天的时间就有三千人战死，伤者不计其数，城中的守军见状更是士气高涨，抵抗变得越发顽强。
整整七个月，蒙古大军未得存进，这并不是因为他们的战斗力不够强，而是因为术赤和察合台这哥俩又掐起来了，两个人经常发出相悖的指令，导致大军进攻之时掣肘颇多。
知道这个消息后的铁木真大怒，派了一名使者带着他的旨意亲自前往玉龙杰赤外的蒙古大营，撤掉了术赤与察合台的统帅位置，让窝阔台来担任主帅。
窝阔台接任之后先是将术赤和察合台的矛盾缓和，而后又犒赏三军，提高了将士们的士气，最后则是成立了一支执法队，让他们开始规范军纪。
在多重措施之下，蒙古大军再次焕发了悍勇之势，仅一次冲锋便登上了城头，而后开始不断地向城内推进；但玉龙杰赤城内的守军和百姓也没有放弃抵抗，他们与蒙古大军展开了惨烈的巷战。
在巷战中，蒙古大军第一次用上了喷火器，将每一个路过的建筑都付之一炬，而后一条街接着一条街的扫荡，经过了七天的苦战，终于将城中的所有抵抗势力全部杀光。
在占领了玉龙杰赤之后，窝阔台下令将全城的人都赶到城外的空地上，在其中择取了十万工匠押回草原，其余的人尽皆屠杀殆尽，据不完全统计，有将近一百二十万人死于这次屠杀之下。
做完这些之后窝阔台还不解恨，又下令引阿姆河中的河水入城，将整座城市市化为一片泽国。
花剌子模的土地，至此尽为蒙古国土。
在攻占玉龙杰赤之后，察合台与窝阔台二人便带大军去与铁木真会合，术赤却没有得到召回的命令，反而被通知要他去封地中驻守；于是术赤便率军北上，前往锡尔河以北的辎重营地驻扎。
望着大军远去的背影，坐在马背上的术赤第一次感觉到了孤独，他知道，自己再也回不去家乡了。
此时的铁木真体会不到术赤的心绪，他现在更想做的是将花剌子模的余孽全部剿灭。
因为此时的扎阑丁与帖木儿灭里两人已经在哥疾宁城聚拢了八万士兵，并暗中联络已被蒙古军占领的诸多城市，准备开始反攻。
收到消息后，铁木真第一时间便准备御驾亲征，亲自荡平这花剌子模的最后一股抵抗势力，但随军而来的大断事官失吉忽秃忽却主动要求领兵前去；因为失吉忽秃忽平时品行端正，而且还非常自律，铁木真觉得可以锻炼一下他的作战能力，于是调派了三万蒙古骑兵给他，让他去剿灭扎阑丁。
但铁木真却忘了一件事，一个人的品格和能力是不成正比的，失吉忽秃忽当断事官没有问题，但领兵作战不同于处理官司，需要的不仅仅是刚正不阿。
在八鲁湾地区，失吉忽秃忽率领的三万骑兵遭遇了严阵以待的扎阑丁大军，眼见着花剌子模的军队远多于自己，失吉忽秃忽急忙下令让士兵们连夜扎假人放置于随行的战马之上，用来迷惑敌军；不过他没注意的是八鲁湾的地形。
第二天清早，不明情况的花剌子模大军见到一夜之间蒙古人竟然又多了这么多，以为是蒙古大军的主力到来，一部分人心生畏惧想要撤退，但扎阑丁明白，一旦撤退花剌子模将彻底无可救药，于是便抽刀出鞘，大声呼喊着振奋士气，而且还主动发起进攻。
蒙古大军自然不甘示弱，正面朝着扎阑丁的军队杀去，但此时地形的限制作用就显现出来了，因为峡谷的宽度不够长，蒙古骑兵没法像往常一样以骑射之术消耗敌军，只能挥舞着马刀与花剌子模士兵正面交战，在死亡的面前，花剌子模士兵也爆发了强大的战斗力，与蒙古士兵的对砍中丝毫不落下风，做到了一命换一命。
在这种消耗战术之下，蒙古大军的伤亡骤增，失吉忽秃忽急忙下令全军后撤，但峡谷的出口狭小，无法让大军快速通过，扎阑丁还在峡谷两侧布置了大批的弓箭手；在前有堵截后有追兵的情况下，三万蒙古大军全军覆没，仅有几名亲卫保护着失吉忽秃忽逃了出来。
此一役使得花剌子模军队士气大振，也极大地鼓舞了各地反抗军民，让他们认识到蒙古军队并不是战无不胜的，也让他们对于推翻蒙古统治的想法越加强烈。
但打了胜仗的扎阑丁此刻却根本高兴不起来，正所谓可以共患难不可以同富贵，在此战过后他手下最重要的两个将领便因抢夺战利品而爆发了内讧，其中一人愤怒之下主动率军离开，扎阑丁的队伍眨眼之间便支离破碎，只好又退回了哥疾宁城驻守。
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