他在崇祯朝，早已深为痛恨文官集团把持朝堂，蒙蔽皇帝，为一己私利行坑害社稷和百姓之事，当即详细的为朱慈煃解说起“五军都督府”来。
五军都督府，创设于元至正二十一年（1361年），起初为大都督府，朱元璋初置统军大元帅府，后改为枢密院，又改之为大都督府，节制中外诸军事。
至洪武十三年（1380年），明太祖朱元璋以“权不专于一司，事不留于壅蔽。”为由将大都督府一分为五，自此之后成为定制。
由最初的掌天下兵马大权，主导国家军事建设的实权机构逐渐虚有其名；从任职人员上看，由功勋宿将位列其中，到掌府官员尸位素餐；从其与兵部的关系看，由以都督府为主，到两者之间相互牵制，再到兵部凌驾于五府之上成为国家军事的最高管理机构。
大都督府是明朝中军都督府、左军都督府、右军都督府、前军都督府、后军都督府五都督府的总称，统领全国军队的最高军事机构。
各都督府设左右都督（正一品）。都督同知（从一品）、都督佥事（正二品），其属有经历司经历（从五品）、都事（从七品）等。都督初间以公、侯、伯为之，可参与军国大事。
正统十四年（1449年）七月，发生的土木之变，是对五军都督府发展变化带来巨大影响的重要事件。
其一，一批重要的公侯都督官，在土木之变中阵亡。
其二，以于谦为代表的兵部，地位迅速上升。总督军务、掌握兵戎、总兵之权，实际上都是之前五军都督府所掌握的军队的管理权和指挥权，现在均由于谦一人掌握。
文官开始插手并逐渐掌控军事。
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