随着形势的发展，大学士的权力逐渐凌驾于六品尚书之上，成为实际上的宰相。内阁权力的扩大，使得五军都督的权力受到了抑制。武将们虽然官至一品，但不过是徒有虚名，实际权力比起大学士，简直是相差甚远。大学士掌握了实权，品级自然也得到了提升。
另外，地方上的武官相对来说，是比较惨的。当时，社会国泰民安，国家对军队的需求显得不再重要，使得武官的权力随之降低。
一个管理一省军队的都指挥使，管辖人数也不过几十万，而一个省的布政使，官级虽低，却管辖着上百万乃至上千万的人口，权力大小自然是不言而喻。
地方行省三权分立后，渐渐出现了监管不力，办事拖拉的现象，使得巡抚制度随之而生。巡抚成了地方上的最大长官，一般由文官担任。
这样，上有朝廷大学士，下有地方巡抚，文官势力在全国滋生蔓延，发展壮大，使得重文轻武的现象越来越严重，导致武将地位一落千丈，跌到低谷。
名将戚继光在写给首辅张居正的信中，自称“门下走狗”，并送外国美女数名及重金，获张居正支持，才得以平灭祸乱一时的东南沿海倭寇。
可见明代朱慈煃之前武将地位之低。
赵正再无迟疑，立即安排全军做好进攻准备。
经二个时辰激战后，在长汀关下，朱慈煃军东西夹击，歼灭郑芝龙军七万余人，余者皆降。
俘虏朱由崧等君臣三十余人，郑芝龙家族二百余人。
赵正一边飞鸽传书朱慈煃，准备班师回朝，一边等待朝廷派官吏与驻军接收福建全境。
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