三天后，宇航船即将进入神石卫星的大气层。此时，小四的身体已经恢复了很多，自由活动是不成问题了，但还不是最佳的状态。小四来到总控室，准备控制宇航船穿过大气层完成降落。这时，系统报告了大气层的情况比较糟糕，建议开启能量护盾。小四在窗口也观察了大气层，发现情况确实很糟糕。现在不仅有好几个活动的大型风暴，还伴随着大量的闪电。上次他和生物学家离开的时候，并没有回头看，所以他也不知道是哪一次更严重。如果上次的情况和这次一样，那小四可觉得自己和生物学家真是命大，也多亏是没亲眼看到，要不然肯定是会被吓傻的。这一次事先看了一眼，要不是宇航船有能量护盾，小四真觉得穿越大气层就是在玩命。系统测算出了最佳的飞行路线，宇航船开始进入大气层，小四便开启了能量护盾。在宇航船进入大气层之后，小四没有像上次那样闭上眼睛，他就一直看着屏幕上显示的能量护盾和能源的情况。一道闪电从宇航船的前面划过，看着就吓人，小四的心脏也猛跳不止。他看着系统没有发出任何异常警报，还没来得及庆幸，一道闪电就突然击中了能量护盾。系统立刻发出了警报，显示能量护盾受损百分之三十五。系统开始自动调用能源修复能量护盾，但修复进度非常缓慢。在母星时，宇航船被卫兵射击，能量护盾才受损了百分之一，这让小四知道了闪电的威力有多可怕。照这样算来，如果再有两道闪电击中宇航船，小四就完蛋了。幸好之后再没有闪电击中宇航船，宇航船平安地穿过了大气层。虽然穿越大气层只用了几分钟，但小四却感觉过了好久。穿过大气层之后，虽然没有了闪电的威胁，但天气也是很糟糕的。周围狂风大作，飞沙四起，能见度非常低。如果没有宇航船的自动驾驶功能，根本就不可能找到目的地，并顺利降落。二十分钟后，宇航船平安着陆了，着陆点距离遗址入口不到三十米，但由于风沙太大，小四根本看不见入口在哪。根据系统对外面的风力测算，以小四的体重根本站不住，所以他需要佩戴负重才能出去。小四穿好宇航服，进入变压舱，绑好负重，准备出去。小四对变压舱可是记忆深刻，因为他在王国组织古堡地下的宇航船时，就是死在了变压舱。所以在内舱门关闭的时候，小四感觉有点恐惧。其实宇航船内外的压强差不算太大，但为了保险起见，在系统的提示下，小四才决定通过变压舱到外面去。变压舱的气压在系统的控制下调节完毕，外舱门打开，小四慢慢地走出宇航船。神石文明的宇航服比母星的先进很多，只是小四了解得很少，为了防止在沙尘中迷失方向，找不到宇航船，他就用安全绳把自己和宇航船连在了一起。由于风沙太大，根本无法分辨方向，小四只能绕着宇航船一圈一圈地寻找，走完一圈，就把安全绳放长一段距离。因为佩戴了负重，所以小四走得比较费力，并且速度缓慢。在小四走到第八圈的时候，他突然脚下一滑，向下陷了进去。小四本能地抓紧绳子，想停止下陷，但因为太重，就没能成功。小四一开始是垂直向下陷，下陷一段距离后又变成了斜向下滑，最后在平面上停了下来。这一过程让小四刚恢复的身体疼得够呛，他干脆就躺在地上没起来。小四缓了一会，打开了宇航服上的照明灯，当他看到上方的星空图时，说了一句自己又回来了。这里就是遗址，也是神石宫殿，刚才小四滑进来的地方，就是上一次他们进来的入口。因为风沙太大的缘故，入口就被掩埋了，所以小四才会以这种方式进来。因为宫殿深埋在地下，所以完全没有受到风沙的影响。小四把负重卸了下来，绑在了安全绳上，之后便继续前进了。小四在下到第二层时，直接来到了石桌跟前，利用安拉的笔记，他把石盘上的文字翻译了过来。根据文字的内容，小四弄明白了这个石盘的作用，原来它是用来控制迷宫陷阱的。至于其他的符号，并不是神石文明的文字，在笔记上也没有记载，所以小四还不知道它们的含义。小四又去看了一下那具银色的修炼者遗骸，现在他自己也是修炼者了，于是就尊称了一声前辈。在第三层，小四已经从零那知道了迷宫的运作是靠神石提供的能源，而现在神石能量封印在自己体内，他就没有忌惮地通过了迷宫。在小四经过地质学家的尸体时，他停下了看了一眼，由于环境干燥缺乏水分，尸体已经变成了一具干尸。小四猜测能源学家的尸体可能也是这个情况，而他觉得很碍眼，就决定有空的时候处理一下。小四继续前进，没有在第二层停留，直接去了第一层。当小四再次看到那副站在台阶底端的盔甲人时，还是被吓了一跳。虽然他知道它不会攻击自己，但还是静静地从它旁边绕了过去。小四走到了密道的入口处，看到了能源学家的尸体。确实像他猜测的那样，这具尸体也变成了干尸，但没有那么严重，他估计是这里的湿度比迷宫大一些的缘故。小四进入密道，在前进的过程中，他又有了上次离开时的感觉，并且这次更明显。小四想起了零说过的话，他猜想密道的建造材质应该就是神石能量的导体，而自己的感觉应该就是体内的能量和密道的感应。小四越过裂缝，来到了地宫，也就是神坛的石门前，他依旧没办法打开石门，但这件事也不用着急。只不过现在想要进去，还是要走他曾经挖出来的通道。小四没有急着进去，而是原路返回了。在接下来的一段时间里小四可就忙了，因为他把需要在宫殿和神坛用的东西都从宇航船里搬了过来。小四把能源学家和地质学家的尸体搬了出去，与外面的三具尸体放在了一起。他还把进出神坛的通道进行了修缮，这样就可以方便进出了。小四想把战友的遗体和修炼者的遗骸给埋葬了，可因为外面的风沙太大，所以就只能把他们葬在了神坛里。在挖掘神坛地面的时候，小四偶然挖到了一个灰色的石盒。石盒的长宽高分别有三十、二十和十公分，它表面光滑，上面只有一个八角形的图案。
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