袁绍听后打算听从沮授的建议，但淳于琼等人认为要复兴汉室太难，而且迎立汉帝会削弱自己的权力，劝袁绍不要用此计策，袁绍于是放弃。
次年，曹操却在荀彧的支持下迎献帝迁都许县，成功挟天子以令诸侯。
公元200年，在官渡之战前夕，沮授就集合宗族，大散其财并说：
“袁公在官渡胜利的话，我们就会有威无不加，但战败的话连自身也不能保住，真是悲哀啊！”
沮授的弟弟沮宗不认同说：
“曹操的军士马匹不足我们，兄长你何必惧怕呢？”
但沮授看得出曹操的雄才说：
“以曹兖州的大略，又有挟天子为资本，我们虽然攻灭公孙瓒，但军士疲倦，将军骄横，军队的破败正在这一举，扬雄说：‘六国蚩蚩，为嬴弱姬’，就是这样。”
官渡时，袁绍进军黎阳，遣颜良攻刘延，沮授劝说：
“颜良性格狭窄，虽然勇猛但不可独自任用。”反对以颜良独自领军，但袁绍不听。
后曹操救刘延，斩杀颜良，在袁绍将渡河之前，沮授又认为袁军应该留守延津，分兵进攻官渡，若然战胜，再增兵官渡也不迟，否则兵众也可以安全撤离，但袁绍仍然不听。
沮授叹息称病不见，袁绍因此憎恨他，将沮授其所余部队交由郭图统领。
袁绍渡河后，驻屯延津南，遣刘备、文丑向曹军挑战，曹操领军击破，文丑更被曹军击杀，震撼袁绍军。
后曹操回到官渡，沮授向袁绍说：“河北兵虽然人多势众但勇猛不如河南兵，河南的粮少而财少过河北。
河南利于速战速决，河北利于缓慢战斗，缓慢抵抗拖长战事。”建议以持久缓进的战术来消耗曹军，但袁绍又不听从。
袁绍攻曹操，初战胜，起高楼射箭入曹营，但后为曹军发石车击破。
后来曹军击破袁绍运输队，袁绍于是命淳于琼领军带领运输车，据守乌巢。
沮授又建议派遣蒋奇护送，以防止曹军攻击，但袁绍又不从。
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