因为人质被挟持，排除了四大家族动用大威力武器的可能，只能派遣大量的原力者试图进入漓江塔夺取人质。这样一来，死鱼眼防御系统唯一的弱点被抹去，无数的原力者饮恨在超级计算机的恐怖计算能力下。
最后一分钟，方天、莉和温斯顿安全到达月球基地。
而同时，百合等人借助漓江塔顶楼的隐匿系统，使用滑翔翼撤离漓江塔。
一个小时后，方天三人切断黑潮在月球基地的联络信号塔，断绝月球和地面的所有联系。
任务完美达成。
要知道，月球基地是专门负责巨型猩猩的研制和培育。而巨型猩猩和人造智械，是黑潮威胁世界的两大武器之一。切断月球基地，等于断去黑潮一只手臂。
一个月后，黑潮将所有希望寄托在人造智械上。早有计划的智械中枢疯狂制造出恐怖的智械，并在智械中枢的控制下，开始攻击人类。
又一个月，温斯顿和方天占领月球基地，消灭所有武装力量后，留下温斯顿，方天独自一人回归地球。
在直布罗陀观测站，方天重逢两个月未见的尼尔。走出悲伤阴霾的尼尔，展现出他的天赋异禀。他秘密招收了一群年轻的学习者，学习他从绿洲城中带出的光束科技。
在方天和尼尔的共同努力下，冰封议会被消灭后的第一次英雄联赛重新召开。
包括方天在内的一批年轻原力者获得英雄称号，成为对抗黑潮组织的中坚力量。
带着这一群世界新生的守护者，尼尔和方天完善之前成功率无限接近于零的计划，突击黑潮总部！
黑潮总部，是拥有超级计算机让娜、超级计算机泰瑞尔、超级计算机凯瑟琳、无数的智械、功率最大的防护屏障的世界最坚固的堡垒。
这在正常情况是绝不可能攻陷的基地。
然而通过世界第一黑客西摩和76的共同努力，将一则至关重要的信息传播在了网络至深处。
网络至深处，比深网、暗网更加隐蔽，能够交流的……唯有超级计算机！
在绿洲城破灭之时，绿洲城已经研制出拥有独立身体的智械——露娜。这成了方天和尼尔重要的砝码。
方天和尼尔允诺给予智械独立自由的身体，让智械不再受到智械中枢的管控，以此换取智械对黑潮的反叛。
自由的力量，驱使这些拥有自主意识的智械和方天等人联合。
重新掌握死吧死吧帮的麦克雷和狗王；
月亮公司的夏娃和76；
带领空之猎人的恭；
从地狱归来的白鼠；
成为花村之主的半藏；
由朵朵和小美作为先锋的守望组织；
还有无数独立的个体如战地医生瑞秋、天行者公司的老板托比昂、铁拳训练营的查莉娅和叛丁、赏金猎人安娜……
所有力量万众一心，毕其功于一役。
内外夹击，在无数守望成员和其他组织成员的牺牲下，成功破灭黑潮组织，摧毁有史以来最大的恐怖组织。
然而世界并没有停止哭泣和悲伤，一场新的战役在黑潮灭亡之后展开。
拥有独立个体获得自由的智械们，分成两派，其中占据大多数的，为了争取和人类同等的全力，成立智瞳组织。旨在通过各种手段争取智械生存在世界上的权力。
黑潮破灭后逃离的成员之一黑寡妇，击杀智瞳组织领袖孟达塔，全面挑起人类和智械的矛盾。
一场人类和智械，充满硝烟和死亡的战役拉开序幕。
来不及为死者哀伤的守望组织重新聚集世界上的原力者精英，加入到这场智械大战之中。
而从绿洲城带出的石板中，黑影发掘出了原力的秘密。这个秘密掌握在那些拥有金原力者的身上。
于是黑影向金原力这发出了邀请函。
为了获得战胜智械的力量，方天加入其中，并成功破解出金原力、以及黄金大门后面的秘密。
九扇黄金之门、一扇白象牙门、一扇黑檀木门。
当意识中的十一扇门全部打开，原力的来源、出现、实质，都如掌上观纹，一清二楚，并能完全用科学解释清楚。
获得门后力量的方天，迫使智瞳组织签订下智械合约，终止了这场智械危机。
作为代价，守望组织永久解散，除非人类面临灭绝的危机，否则永不重启。智械拥有和人类等同的权利，共同生存在这个美丽的星球上。
世界进入总体和平、局部战争，总体缓和，局部紧张的态势。
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