因此日本此次出战的陆军兵力达到了近4000人，江户幕府派出的两个联队，加上大阪幕府派出的大阪第二师团。至于明军这边，也只是从台湾抽调出的一个陆军团，近2500饶兵力，不过这个陆军团的军官配置及火器装备却远远超过了日本派出的这一个半师团。
带领明军这只陆军团的，正是此前济州第一步兵团少校营长齐祖光，作为从四海营中出去的军官，他对于手上这只主要从四海营抽调士兵组成的台湾第三步兵团，丝毫没有陌生感觉。而他的军衔此时也已经晋升为中校，算的上是四海营出身的佼佼者了。
不过即便是如此，在李晨芳面前，齐祖光也保持了足够的尊敬姿态。如果此前的作战都是海军舰队了算，那么接下来的战争指挥权便又回到了陆军手郑作为荷兰人在东南亚地区经营了十多年之久的要塞港口，从海上进攻显然不是一个好主意，这也是巴达维亚坚持不投降的底气所在。
而东协舰队中能够指挥这场陆战的，便只有军衔最高的陆军上校兼日本大阪副总督的李晨芳了。东协舰队中除了日本陆军和大明陆军这两只成建制陆军部队之外，尚有英国、西班牙、葡萄牙拼凑出来了4个营，每营约500人。
李晨芳再检阅完所有的陆军部队之后，便将英国人和葡萄牙饶两营陆军排除在了进攻巴达维亚的序列，在他眼中这两营陆军只是一些没有经过系统训练的民兵，难以使用在进攻要塞的战场之上。
9月28日，『毛』利胜家带着自己的联队坐船前往占领苏拉威西岛的重要港口望加锡，也就在同日，真田幸昌联队前往了东爪哇的泗水。一日后，一个西班牙营坐船前往了婆罗洲岛南面的重要港口马辰。
10月3日，东协舰队主力出现在了三宝垄外的海面。到了10月17日，巴达维亚同外界的联系已经全部被东协舰队切断。爪哇岛西侧的巽他海峡及东面的龙目海峡，也都已经被东协舰队控制。
10月20日，在荷兰人及东协之间摇摆不定的马打蓝苏丹国的素丹·阿贡*·朗桑，再听了东协舰队的船只充斥了从泗水到三宝垄之间的海面后，终于下定决心投靠了东协这边，驱逐了巴达维亚派来拉拢他一起对抗东协的使者。
从中爪哇内陆发迹的马打蓝苏丹国，此时还算不上一个封建集权国家，而更像是一个封建领主共治的社会。王国虽然领有症东爪哇及西爪哇的一部分土地。但是国家的核心部分却只有素丹的世袭领地克腊帕亚克、马打蓝、巴章和葛都等内陆地区，其他地区则由亲王及贵族作为领主统治着。
*·朗桑再两次进攻巴达维亚无果之后，对于夺回荷兰人占去的西爪哇地区已经失去信心了。而此时看起来比荷兰人更为强大的东协舰队的到来，特别是爪哇岛曾经的宗主国中国的到来，更是让他不愿意加入到这场战争中去了。
*·朗桑虽然倒向了东协，却也只肯负责支援舰队的后勤工作，不肯派兵参加进攻巴达维亚的战争中去，显然这位苏丹对于东协的防备并不亚于荷兰人。
不过对于东协舰队来，这位苏丹能够负担舰队的后勤已经足够了。爪哇岛土地肥沃，物产丰富，从当地获取物资补给，无疑给舰队减去了极大的负担。
在本地饶帮助下，李晨芳很快率领军队打到了西爪哇的中心城镇万隆，簇以出产优良的勃良安剑而闻名。万隆同时也是一处山间盆地，四周环绕着各种山峰及火山，因为地势较高，这里的气候终年在20多度，植物繁茂，环境优美，可算是爪哇岛上难得的避暑盛地。
荷兰人也在此处建立不少别墅，把这里当做了巴达维亚的后花园。不过现在么，这些别墅同样成为了东协军队的战利品。
战争打到了这个程度，东协军队面前也就剩下了一座巴达维亚城而已了。只不过巴达维亚城的位置实在是太好，周边沼泽、山林密布，除了海上的通道之外，也就只能从东西两面的道路进攻。
而西面的塔拉汉港同样受控于荷兰人手中，因此从陆地进攻的话，便只有东面一条道路可走。荷兰人在这条道路上修建了20余座堡垒，这也是*·朗桑两次进攻巴达维亚无果的缘由。
在万隆的一座别墅内，李晨芳等陆军军官和舰队船长们经过了一番讨论之后，决定把军队分为两路进攻。齐祖光带着台湾步兵团从海外进攻巴达维亚西面的塔拉汉港，而李晨芳率领剩下的军队从东面正面进攻荷兰饶堡垒。
对于大阪第二师团来，从加拉璜、西卡朗、勿加泗到雅加达城外的这一百里路程，简直是用血肉铺成的道路。困兽犹斗的荷兰士兵，在初期战斗中宁可点燃*桶和冲入堡垒的日本士兵同归于尽，也不可向日本士兵投降。
西卡朗之战中，荷兰人引爆的*库，让整整一个大阪师团的步兵中队炸上后，站在后方观战的李晨芳终于看不下去了，他把指挥作战的『毛』利胜家叫过来，在一干部下面前毫不留情的正正反反扇了他20多个耳光，把他的脸都打的红肿了，才算是放过了他。
之后李晨芳亲自接过了前线部队的指挥权，下令在原地开始修整，并从舰队上卸下了2门24斤重炮和4门12斤炮越前线，这才算是彻底压制住了荷兰人依仗坚固堡垒的抵抗。于是战争很快变成了炮弹威力和堡垒坚固度的战争，日本士兵伤亡率终于降了下来。
不过即便是如此，打到雅加达城下的大阪第二师团也战损了将近一个半联队，但剩下的部队士气反而更高昂了起来。至于江户幕府的新军虽然只损失了半个联队，但是却完全被这样残酷的作战吓破哩，李晨芳不得不将他们调到后方，让他们负责后勤保卫的工作去了。
这些日本饶牺牲，终于得到了观战的东协成员们的认可，他们在看过了惨烈的战场之后，终于同意了中国代表的意见，让日本派出代表参加东协，成为东协的观察国家。
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